77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2951 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  64.98 
 
 		 998 aa  948    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.14 
 
 		 786 aa  728    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 762 aa  1558    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  61.9 
 
 		 864 aa  870    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  49.72 
 
 		 1105 aa  638    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  73.56 
 
 		 851 aa  1034    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  50.14 
 
 		 1100 aa  696    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  51.04 
 
 		 875 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.73 
 
 		 927 aa  599  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  52.73 
 
 		 775 aa  541  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  42.08 
 
 		 1224 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  42.6 
 
 		 895 aa  535  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  50.17 
 
 		 812 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  38.58 
 
 		 885 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.92 
 
 		 867 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  37.36 
 
 		 874 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.41 
 
 		 611 aa  352  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  35.11 
 
 		 578 aa  264  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.7 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  30.24 
 
 		 591 aa  241  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  33.5 
 
 		 854 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  30.9 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 649 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  29.78 
 
 		 571 aa  220  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  30.77 
 
 		 646 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  31.12 
 
 		 537 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.59 
 
 		 833 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 1601 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.73 
 
 		 900 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 632 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  27.21 
 
 		 739 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.66 
 
 		 978 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  26.3 
 
 		 665 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.39 
 
 		 2042 aa  85.1  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 		 606 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.67 
 
 		 1076 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.88 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  25.16 
 
 		 906 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  23.79 
 
 		 621 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  24.84 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  22.27 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  24.75 
 
 		 880 aa  67.8  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  24.36 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.41 
 
 		 887 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 1137 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  24.21 
 
 		 757 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 846 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.06 
 
 		 985 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  22.57 
 
 		 707 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  23.53 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  24.3 
 
 		 847 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  28.57 
 
 		 559 aa  55.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  25.4 
 
 		 575 aa  52  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 611 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  24.7 
 
 		 715 aa  51.2  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  27.8 
 
 		 609 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  24.33 
 
 		 778 aa  50.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  22.47 
 
 		 570 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 789 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 736 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 928 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  23.43 
 
 		 949 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  24.48 
 
 		 613 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  22.05 
 
 		 1369 aa  48.9  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  23.25 
 
 		 1452 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  23.9 
 
 		 1759 aa  48.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  22.07 
 
 		 737 aa  48.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 1321 aa  47.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  24.19 
 
 		 574 aa  47.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  28.44 
 
 		 653 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 613 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25 
 
 		 1414 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  23.13 
 
 		 990 aa  44.3  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>