25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0426 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  54.46 
 
 		 613 aa  680    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 613 aa  1276    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  55.9 
 
 		 609 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  40.99 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  39.73 
 
 		 579 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  41.81 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  40.17 
 
 		 575 aa  425  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  39.76 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  36.12 
 
 		 1452 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  34.12 
 
 		 606 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  28.17 
 
 		 1076 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  27.03 
 
 		 875 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1217 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  26.91 
 
 		 815 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  20.49 
 
 		 1601 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  25.7 
 
 		 665 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  25.82 
 
 		 833 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  28 
 
 		 775 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  25.72 
 
 		 591 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.86 
 
 		 998 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25 
 
 		 762 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 1224 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 895 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  25 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  26.15 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>