138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0737 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
526 aa  1085    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  55.43 
 
 
563 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  50.8 
 
 
686 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  47.51 
 
 
707 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.57 
 
 
887 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  35.02 
 
 
611 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  40.47 
 
 
730 aa  351  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  42.23 
 
 
725 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.04 
 
 
985 aa  340  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
961 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  38.76 
 
 
1369 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  39.09 
 
 
1759 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  38.66 
 
 
736 aa  325  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.92 
 
 
880 aa  324  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  36.29 
 
 
949 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  34.86 
 
 
742 aa  320  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  36.88 
 
 
715 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 
928 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 
846 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  36.28 
 
 
757 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 
739 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  38.31 
 
 
984 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  37.37 
 
 
794 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  35.39 
 
 
778 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  39.91 
 
 
847 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  39.1 
 
 
990 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  35.97 
 
 
789 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  37.37 
 
 
1017 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  36.02 
 
 
710 aa  293  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  34.95 
 
 
1137 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  33.86 
 
 
737 aa  272  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  36.95 
 
 
894 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  35.27 
 
 
854 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  32.13 
 
 
2042 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  29.8 
 
 
978 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  28.3 
 
 
590 aa  147  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
649 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  27.71 
 
 
885 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  25.88 
 
 
646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  27.39 
 
 
874 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  23.11 
 
 
537 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  24.2 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  23.34 
 
 
591 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  24.33 
 
 
854 aa  77.4  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 
895 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.57 
 
 
998 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  24.95 
 
 
833 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  24.57 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24 
 
 
867 aa  67.8  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  57.41 
 
 
722 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 
534 aa  67  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  24.4 
 
 
587 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.41 
 
 
582 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  37.89 
 
 
477 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.56 
 
 
927 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  48.61 
 
 
532 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  59.32 
 
 
460 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 
1601 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  48.39 
 
 
298 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  22.76 
 
 
864 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  22.2 
 
 
906 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 
812 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 
539 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  56.14 
 
 
584 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  23.58 
 
 
570 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  23.87 
 
 
623 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  51.67 
 
 
577 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  45.16 
 
 
780 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
536 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  46.55 
 
 
955 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  22.5 
 
 
1076 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  44.29 
 
 
295 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  50.88 
 
 
746 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 
1224 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.19 
 
 
786 aa  54.3  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  45.76 
 
 
435 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  52.73 
 
 
604 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  20.98 
 
 
900 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  53.57 
 
 
1122 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.47 
 
 
537 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 
590 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  21.66 
 
 
1100 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  48.28 
 
 
308 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  50.85 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.27 
 
 
762 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  40.3 
 
 
621 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  34.19 
 
 
552 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  20.4 
 
 
621 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.76 
 
 
528 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  41.94 
 
 
436 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  47.27 
 
 
583 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  25.1 
 
 
815 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  23.37 
 
 
775 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.27 
 
 
1209 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  41.27 
 
 
873 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  37.29 
 
 
477 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  38.57 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  43.1 
 
 
533 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.3 
 
 
411 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>