67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0636 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0636  cellulase  100 
 
 		 578 aa  1185    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  45.55 
 
 		 587 aa  482  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  45.41 
 
 		 854 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.16 
 
 		 582 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  44.86 
 
 		 571 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  35.77 
 
 		 591 aa  326  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 649 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  35.05 
 
 		 646 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.96 
 
 		 867 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  35.23 
 
 		 885 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.67 
 
 		 927 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 		 895 aa  250  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.44 
 
 		 762 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  31.81 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  33.22 
 
 		 874 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35 
 
 		 998 aa  246  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  33.77 
 
 		 851 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  33.21 
 
 		 875 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  34.16 
 
 		 775 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 1224 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  33.85 
 
 		 864 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.4 
 
 		 786 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 812 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  31.53 
 
 		 1100 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 1601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.8 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  30.37 
 
 		 1105 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  29.93 
 
 		 833 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.25 
 
 		 900 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  29.93 
 
 		 739 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  28.01 
 
 		 665 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.85 
 
 		 1076 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 632 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  29.02 
 
 		 803 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.84 
 
 		 621 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.54 
 
 		 906 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  23.77 
 
 		 815 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  25.5 
 
 		 978 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  24.57 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.39 
 
 		 2042 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  23.45 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  27.85 
 
 		 653 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 710 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24 
 
 		 887 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 846 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  27.67 
 
 		 613 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  33.57 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 611 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  25.27 
 
 		 623 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  25.73 
 
 		 686 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 		 742 aa  53.9  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  23.79 
 
 		 1759 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  26.95 
 
 		 794 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 730 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  24.07 
 
 		 778 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  24.76 
 
 		 559 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  31.25 
 
 		 990 aa  47.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  32.46 
 
 		 847 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 739 aa  47  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 789 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 736 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 613 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  29.31 
 
 		 984 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  29.73 
 
 		 737 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>