75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1280 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  100 
 
 		 571 aa  1183    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.62 
 
 		 582 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  47.57 
 
 		 587 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  49.64 
 
 		 854 aa  538  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  44.86 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  37.07 
 
 		 591 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 		 649 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  32.32 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 		 895 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 1224 aa  250  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.2 
 
 		 927 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  31.6 
 
 		 885 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  31.35 
 
 		 1100 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.82 
 
 		 998 aa  243  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  31.99 
 
 		 537 aa  243  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.85 
 
 		 867 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  32.75 
 
 		 775 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  32.07 
 
 		 874 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  31.18 
 
 		 864 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  32.75 
 
 		 875 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 812 aa  220  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.61 
 
 		 611 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  29.33 
 
 		 1105 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.31 
 
 		 786 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.78 
 
 		 762 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  29.51 
 
 		 851 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 1601 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.83 
 
 		 833 aa  171  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.31 
 
 		 900 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  28.37 
 
 		 739 aa  140  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 632 aa  130  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  27.06 
 
 		 665 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 606 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  30.24 
 
 		 803 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.01 
 
 		 1076 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.36 
 
 		 906 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.38 
 
 		 621 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  24.44 
 
 		 815 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.09 
 
 		 887 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  24.2 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  23.47 
 
 		 725 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  23.4 
 
 		 978 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26.28 
 
 		 2042 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 742 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  21.38 
 
 		 928 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  24.4 
 
 		 984 aa  73.6  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  22.88 
 
 		 563 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.26 
 
 		 985 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  23.42 
 
 		 949 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 730 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  25.27 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  26.4 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 739 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  22.84 
 
 		 880 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  24.02 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  22.74 
 
 		 757 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  23.67 
 
 		 1369 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  22.14 
 
 		 794 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 		 846 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  24.24 
 
 		 847 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  24.29 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  25.3 
 
 		 990 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  23.99 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 961 aa  50.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  23.3 
 
 		 1759 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 710 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  24.18 
 
 		 623 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  22.13 
 
 		 894 aa  47  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  27.41 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 613 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  22.7 
 
 		 837 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>