185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1648 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  49.41 
 
 
984 aa  739    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  54.34 
 
 
757 aa  754    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  53.2 
 
 
928 aa  960    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
949 aa  1976    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  74.34 
 
 
961 aa  1523    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  48.92 
 
 
854 aa  626  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  47.64 
 
 
894 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 
789 aa  482  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 
611 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.05 
 
 
887 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  37.32 
 
 
778 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  36.57 
 
 
707 aa  415  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  36.73 
 
 
686 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 
730 aa  342  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 
742 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  36.29 
 
 
526 aa  323  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  34.22 
 
 
1369 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  32.94 
 
 
1759 aa  318  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  31.41 
 
 
715 aa  314  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
846 aa  313  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  30.97 
 
 
737 aa  310  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  37.6 
 
 
563 aa  310  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 
736 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 
710 aa  305  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 
739 aa  304  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  33.09 
 
 
880 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  33.14 
 
 
725 aa  300  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.88 
 
 
985 aa  292  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  31.33 
 
 
794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  31.08 
 
 
847 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  31.92 
 
 
990 aa  281  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 
1137 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  28.61 
 
 
1017 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  32.94 
 
 
1478 aa  126  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  32.68 
 
 
1414 aa  124  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  41.61 
 
 
1294 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  41.61 
 
 
1904 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.94 
 
 
833 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  38.32 
 
 
522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  36.29 
 
 
658 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 
1224 aa  110  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.25 
 
 
919 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  25.87 
 
 
978 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.74 
 
 
857 aa  107  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  38.41 
 
 
1121 aa  106  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  39.6 
 
 
763 aa  105  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.01 
 
 
938 aa  104  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25 
 
 
2042 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 
1209 aa  100  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  34.46 
 
 
505 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.58 
 
 
1298 aa  99.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  37.58 
 
 
308 aa  99  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  36.24 
 
 
678 aa  98.6  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  39.53 
 
 
473 aa  98.2  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  36.24 
 
 
656 aa  97.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  33.99 
 
 
505 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  34.9 
 
 
671 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 
660 aa  91.3  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
649 aa  90.9  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.52 
 
 
1853 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  34.59 
 
 
1546 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  30.57 
 
 
467 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  24.85 
 
 
646 aa  77  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  32.9 
 
 
619 aa  75.5  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  53.97 
 
 
873 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  35.57 
 
 
2344 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  33.54 
 
 
1050 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  44.21 
 
 
955 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  46.34 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 
728 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  23.42 
 
 
571 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  34.75 
 
 
590 aa  68.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  50.7 
 
 
780 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  28.32 
 
 
732 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  22.54 
 
 
537 aa  67.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  51.47 
 
 
746 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  48.68 
 
 
536 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  22.87 
 
 
591 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  35.58 
 
 
532 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  49.25 
 
 
885 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  49.23 
 
 
524 aa  64.7  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  43.96 
 
 
475 aa  64.7  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 
1077 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.68 
 
 
582 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  41.25 
 
 
477 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  43.08 
 
 
298 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  45.31 
 
 
928 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  41.67 
 
 
391 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 
895 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.27 
 
 
469 aa  61.6  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  52.17 
 
 
951 aa  62  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  36.92 
 
 
948 aa  62  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  46.48 
 
 
1122 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  46.88 
 
 
535 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  46.03 
 
 
462 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  41.03 
 
 
471 aa  61.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  45.45 
 
 
1015 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  45.31 
 
 
965 aa  61.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.79 
 
 
554 aa  61.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  51.52 
 
 
552 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>