More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0617 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  62.66 
 
 
854 aa  833    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  67.29 
 
 
973 aa  1008    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  53.21 
 
 
1759 aa  855    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  59.69 
 
 
785 aa  798    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.73 
 
 
984 aa  758    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.37 
 
 
979 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  57.72 
 
 
854 aa  781    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  52.84 
 
 
1478 aa  854    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  52.61 
 
 
1904 aa  847    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1121 aa  2241    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  58.2 
 
 
894 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  51.27 
 
 
741 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  64.73 
 
 
842 aa  860    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  54.36 
 
 
919 aa  690    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  53.96 
 
 
900 aa  896    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  62.48 
 
 
966 aa  823    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  54.53 
 
 
722 aa  715    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  58.89 
 
 
974 aa  788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  62.23 
 
 
963 aa  840    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.27 
 
 
938 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  98.63 
 
 
1209 aa  298  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  96.58 
 
 
763 aa  290  9e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  93.15 
 
 
678 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  94.52 
 
 
1137 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  93.15 
 
 
656 aa  284  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  93.84 
 
 
1298 aa  283  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  54.05 
 
 
743 aa  197  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  51.48 
 
 
460 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  48.42 
 
 
608 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  82.18 
 
 
403 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  40.88 
 
 
467 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  69.31 
 
 
562 aa  148  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  41.56 
 
 
847 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  50.99 
 
 
1017 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  50.68 
 
 
619 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  46.71 
 
 
1369 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  46.71 
 
 
1294 aa  135  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  46.71 
 
 
1414 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.74 
 
 
998 aa  131  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.61 
 
 
1853 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.36 
 
 
833 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.84 
 
 
727 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  41.23 
 
 
978 aa  124  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  44 
 
 
505 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  43.54 
 
 
505 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.1 
 
 
637 aa  122  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.67 
 
 
985 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  41.89 
 
 
649 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.64 
 
 
880 aa  119  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  40.91 
 
 
429 aa  115  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.1 
 
 
887 aa  115  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  40.44 
 
 
473 aa  112  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  55.56 
 
 
474 aa  111  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  35.76 
 
 
522 aa  111  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  38.76 
 
 
658 aa  111  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.81 
 
 
681 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.99 
 
 
857 aa  108  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  36.98 
 
 
658 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  58.51 
 
 
436 aa  108  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  39.87 
 
 
928 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  38.41 
 
 
949 aa  105  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  37.44 
 
 
543 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 
628 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 
846 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 
1224 aa  102  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  37.74 
 
 
961 aa  102  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.35 
 
 
609 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  54.55 
 
 
449 aa  101  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  32.77 
 
 
1546 aa  100  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  38.6 
 
 
655 aa  100  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  49.02 
 
 
441 aa  100  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  52.69 
 
 
533 aa  99.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  42.24 
 
 
794 aa  99.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  37.45 
 
 
938 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  47.92 
 
 
864 aa  97.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  39.26 
 
 
1007 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.91 
 
 
778 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  55.32 
 
 
775 aa  97.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  52.53 
 
 
460 aa  95.9  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  36.32 
 
 
438 aa  95.9  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  52.17 
 
 
494 aa  95.9  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.09 
 
 
588 aa  95.9  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  48.91 
 
 
688 aa  95.5  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  46.72 
 
 
703 aa  95.5  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.2 
 
 
437 aa  95.5  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  43.27 
 
 
459 aa  95.5  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.65 
 
 
590 aa  95.5  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  53.26 
 
 
596 aa  94.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 
812 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  47.52 
 
 
787 aa  94.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.83 
 
 
518 aa  94  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  46.81 
 
 
455 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  46.81 
 
 
455 aa  93.2  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  46.08 
 
 
448 aa  93.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  44.53 
 
 
942 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  52.13 
 
 
851 aa  93.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  46.81 
 
 
455 aa  92.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  50 
 
 
456 aa  92  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  45.74 
 
 
455 aa  91.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  45.74 
 
 
455 aa  91.3  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>