More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0615 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1209 aa  2378    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  83.91 
 
 
403 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  57.73 
 
 
623 aa  545  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  57.17 
 
 
655 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  56.88 
 
 
646 aa  492  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  54.75 
 
 
572 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  54.99 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.35 
 
 
633 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  51.89 
 
 
1128 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  96.53 
 
 
1137 aa  452  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  51.28 
 
 
628 aa  445  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.04 
 
 
639 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  53.53 
 
 
743 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.93 
 
 
767 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  51.52 
 
 
611 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  92.72 
 
 
1298 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  48.6 
 
 
791 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  48.16 
 
 
596 aa  383  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.9 
 
 
452 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.45 
 
 
588 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.45 
 
 
590 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  47.1 
 
 
605 aa  364  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  47.13 
 
 
620 aa  364  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  46.35 
 
 
589 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  71.67 
 
 
460 aa  334  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  98.66 
 
 
1121 aa  305  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  96.67 
 
 
763 aa  300  9e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  94.59 
 
 
678 aa  296  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  94.59 
 
 
656 aa  294  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.48 
 
 
393 aa  251  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  35.68 
 
 
450 aa  202  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  34.37 
 
 
393 aa  201  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  44.7 
 
 
261 aa  175  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  41.55 
 
 
253 aa  154  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.41 
 
 
1853 aa  154  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  45.33 
 
 
467 aa  152  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  70.3 
 
 
562 aa  147  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  52.67 
 
 
1017 aa  147  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  50.33 
 
 
619 aa  140  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  47.77 
 
 
1478 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  47.4 
 
 
1294 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  47.77 
 
 
1369 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  47.77 
 
 
1759 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  47.77 
 
 
1414 aa  138  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  46.54 
 
 
1904 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  37.17 
 
 
709 aa  135  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.44 
 
 
833 aa  135  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  39.82 
 
 
391 aa  132  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  30.58 
 
 
671 aa  129  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.18 
 
 
985 aa  129  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  40.7 
 
 
505 aa  125  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  32 
 
 
522 aa  124  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  43.04 
 
 
505 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.81 
 
 
887 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.07 
 
 
938 aa  119  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.62 
 
 
919 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  38.22 
 
 
928 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.15 
 
 
857 aa  112  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  39.61 
 
 
658 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  40.44 
 
 
473 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  36.93 
 
 
961 aa  109  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  60.87 
 
 
436 aa  108  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  54.33 
 
 
474 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.27 
 
 
846 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  64.89 
 
 
973 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.53 
 
 
609 aa  106  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  53.26 
 
 
628 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  59.14 
 
 
775 aa  104  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  51.96 
 
 
488 aa  104  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  37.36 
 
 
949 aa  104  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  59.09 
 
 
938 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  53.92 
 
 
727 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.67 
 
 
688 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  34.62 
 
 
1546 aa  103  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  54.35 
 
 
494 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  39.61 
 
 
449 aa  101  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  51.09 
 
 
778 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  42.86 
 
 
794 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  53.26 
 
 
1007 aa  99.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  40.14 
 
 
812 aa  99.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  38.41 
 
 
1224 aa  99  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  47.92 
 
 
864 aa  97.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 
984 aa  97.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  48.91 
 
 
518 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  28.63 
 
 
486 aa  96.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  28.53 
 
 
380 aa  97.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  49.49 
 
 
441 aa  95.9  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 
477 aa  95.5  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  45.19 
 
 
533 aa  95.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  48.15 
 
 
608 aa  94.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50.54 
 
 
489 aa  94.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  47.24 
 
 
942 aa  94  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 
854 aa  94  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.32 
 
 
437 aa  93.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.04 
 
 
448 aa  93.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  30.26 
 
 
501 aa  92.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  47.87 
 
 
455 aa  92  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  47.87 
 
 
455 aa  91.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  40.79 
 
 
703 aa  91.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  49.45 
 
 
376 aa  91.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>