21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1627 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.88 
 
 		 393 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  43.3 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44.13 
 
 		 1209 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  40.19 
 
 		 460 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  36.94 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 709 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 		 391 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1503  Cellulase  28.85 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.299895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  30.17 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11111  cellulase celA2b  33.12 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.02814e-48  normal  0.503236 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1267  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1188  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0484925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3027  hypothetical protein  29.91 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00452  Putative uncharacterized proteinXyloglucan-specific endoglucanase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BG78]  28.05 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1640  hypothetical protein  23.15 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0628  glycoside hydrolase family 12  27.74 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0151118  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7773  hypothetical protein  24.03 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>