19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1503 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1503  Cellulase  100 
 
 		 264 aa  529  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.299895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  84.85 
 
 		 264 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  28.94 
 
 		 393 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  29.82 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1640  hypothetical protein  30.8 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 		 709 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00452  Putative uncharacterized proteinXyloglucan-specific endoglucanase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BG78]  34.6 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3027  hypothetical protein  30.17 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  25.69 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 1209 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  32.73 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  29.44 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02431  cellulase S  27.13 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.657808  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  27.95 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7773  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>