172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4899 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  85.68 
 
 
709 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
391 aa  788    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  64.52 
 
 
253 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.61 
 
 
393 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11111  cellulase celA2b  57.05 
 
 
151 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.02814e-48  normal  0.503236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  52.82 
 
 
516 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  38.83 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  36.36 
 
 
460 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  39.63 
 
 
1209 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  32.43 
 
 
261 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  48.92 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  52.8 
 
 
497 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  45.93 
 
 
492 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.88 
 
 
603 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.31 
 
 
1072 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  43.95 
 
 
801 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  46.4 
 
 
374 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.9 
 
 
933 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  45.67 
 
 
558 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  40.49 
 
 
548 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  45.24 
 
 
634 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  50 
 
 
423 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  39.31 
 
 
801 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  37.91 
 
 
490 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  43.22 
 
 
489 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  45.38 
 
 
801 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  45.45 
 
 
890 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  38.42 
 
 
368 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.11 
 
 
531 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.29 
 
 
493 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  43.7 
 
 
479 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.06 
 
 
498 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.89 
 
 
627 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.96 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  43.7 
 
 
469 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.23 
 
 
803 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  35.88 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  44.96 
 
 
574 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  38.89 
 
 
472 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  42.4 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  43.31 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  41.98 
 
 
535 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  38.64 
 
 
461 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.71 
 
 
580 aa  92.8  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  41.32 
 
 
1128 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  45 
 
 
452 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  40.65 
 
 
468 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  45.08 
 
 
732 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  39.64 
 
 
1207 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  43.55 
 
 
446 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.68 
 
 
489 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.68 
 
 
500 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  38.93 
 
 
522 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  39.2 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  40.8 
 
 
547 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  43.38 
 
 
417 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.4 
 
 
568 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  38.17 
 
 
488 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00452  Putative uncharacterized proteinXyloglucan-specific endoglucanase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BG78]  31.16 
 
 
239 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  36.59 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.33 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  39.32 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  33.75 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1503  Cellulase  28.57 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.299895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  35.29 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.41 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  33.33 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3027  hypothetical protein  32.23 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  37.78 
 
 
165 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  33.11 
 
 
642 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  30.58 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  38.53 
 
 
794 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4913  hypothetical protein  31.63 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.61 
 
 
648 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.71 
 
 
695 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  35 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  48.1 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35 
 
 
1016 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  36.84 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  32 
 
 
644 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  35.04 
 
 
503 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  36.36 
 
 
487 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  34.97 
 
 
566 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1640  hypothetical protein  26.69 
 
 
241 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  40.48 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  35.29 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.82 
 
 
495 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.4 
 
 
815 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  37.31 
 
 
503 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.39 
 
 
1139 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.86 
 
 
672 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  33.85 
 
 
597 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 
571 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  31.85 
 
 
563 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  35.88 
 
 
560 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.06 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  33.58 
 
 
582 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  41.67 
 
 
459 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.2 
 
 
474 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  37.61 
 
 
771 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>