21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2966 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1503  Cellulase  84.85 
 
 		 264 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.299895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4913  hypothetical protein  33.96 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  30 
 
 		 393 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  31.47 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 709 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1640  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 		 1209 aa  70.1  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00452  Putative uncharacterized proteinXyloglucan-specific endoglucanase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BG78]  32.7 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  27.43 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3027  hypothetical protein  29.91 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  32.12 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02431  cellulase S  28.27 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.657808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  27.42 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7773  hypothetical protein  23.72 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02432  cellulase S  31.06 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>