20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3987 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  64.06 
 
 		 709 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  63.68 
 
 		 391 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  48.43 
 
 		 393 aa  244  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11111  cellulase celA2b  52.67 
 
 		 151 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.02814e-48  normal  0.503236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  41.78 
 
 		 1209 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  39.13 
 
 		 403 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  36.84 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  36.94 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00452  Putative uncharacterized proteinXyloglucan-specific endoglucanase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BG78]  31.02 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1503  Cellulase  24.62 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.299895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3027  hypothetical protein  36.09 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  24.62 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4913  hypothetical protein  29.81 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1640  hypothetical protein  25.3 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02431  cellulase S  29.17 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.657808  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7773  hypothetical protein  21.11 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02432  cellulase S  32.76 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  27.72 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>