227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0619 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  100 
 
 
403 aa  788    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  85.6 
 
 
1209 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  72.5 
 
 
460 aa  338  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  42.57 
 
 
393 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  89.11 
 
 
763 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  43.86 
 
 
261 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  89.89 
 
 
1298 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  38.97 
 
 
253 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  90.59 
 
 
1137 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  82.18 
 
 
1121 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  68.32 
 
 
562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  39.07 
 
 
391 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 
709 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  58.16 
 
 
743 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  62.77 
 
 
973 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  42.19 
 
 
609 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.39 
 
 
474 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  52.17 
 
 
688 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  42.24 
 
 
794 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  56.52 
 
 
436 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.26 
 
 
590 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  52.53 
 
 
608 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  52.04 
 
 
477 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  49.46 
 
 
628 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 
518 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.61 
 
 
984 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 
778 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  36.71 
 
 
449 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.61 
 
 
588 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  50.49 
 
 
460 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.46 
 
 
846 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  51.09 
 
 
494 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  48.42 
 
 
533 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  53.41 
 
 
938 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  53.68 
 
 
727 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  52.69 
 
 
596 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  51.06 
 
 
488 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.63 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  49.45 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.02 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  48.98 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  44.34 
 
 
1128 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  48.91 
 
 
1007 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.52 
 
 
479 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  52.53 
 
 
656 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  52.53 
 
 
678 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 
775 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  37.78 
 
 
812 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  47 
 
 
847 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  45.78 
 
 
864 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  48.91 
 
 
894 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  46 
 
 
773 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  47 
 
 
934 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.62 
 
 
925 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  51.06 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  49.45 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  42.06 
 
 
854 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  45.45 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  49.49 
 
 
593 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  45 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  46.74 
 
 
935 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  48.91 
 
 
966 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  50.5 
 
 
978 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  48.39 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  47.52 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.54 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.19 
 
 
743 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.63 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11111  cellulase celA2b  35.57 
 
 
151 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.02814e-48  normal  0.503236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  41.86 
 
 
942 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  48.75 
 
 
851 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  45.65 
 
 
963 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  43.48 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  42 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  45.54 
 
 
673 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  43.88 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  44.57 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.48 
 
 
623 aa  80.1  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  44.79 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  45.16 
 
 
681 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41.84 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  41.3 
 
 
1055 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  43.48 
 
 
880 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  45.74 
 
 
487 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  44.9 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  42.39 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.74 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.3 
 
 
875 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  43.96 
 
 
633 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.48 
 
 
842 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  41.76 
 
 
913 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  45.16 
 
 
605 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  39.39 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  45 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  42.39 
 
 
842 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  43.48 
 
 
744 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.74 
 
 
767 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  42.39 
 
 
491 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.33 
 
 
867 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>