More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4957 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  94.46 
 
 		 726 aa  1064    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  100 
 
 		 688 aa  1358    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  83.77 
 
 		 518 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  69.96 
 
 		 778 aa  251  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  69.71 
 
 		 494 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  31.75 
 
 		 532 aa  203  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  28.82 
 
 		 681 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  39.15 
 
 		 727 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  65.38 
 
 		 935 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  64.71 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  75 
 
 		 1148 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  60.4 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  57.43 
 
 		 393 aa  124  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.63 
 
 		 627 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.68 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.43 
 
 		 648 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  76.74 
 
 		 1016 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.98 
 
 		 984 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  28.34 
 
 		 485 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  55.77 
 
 		 623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  48.28 
 
 		 1007 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  54.9 
 
 		 925 aa  112  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  27.22 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  54.9 
 
 		 775 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  55.77 
 
 		 842 aa  112  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  62.83 
 
 		 674 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  55.91 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  51.75 
 
 		 773 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  51.96 
 
 		 743 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  50.48 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.55 
 
 		 497 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  52.94 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.29 
 
 		 815 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.96 
 
 		 590 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50 
 
 		 588 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  51.82 
 
 		 486 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  53.92 
 
 		 487 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  52.48 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 628 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.08 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.78 
 
 		 486 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  42.86 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  48.08 
 
 		 875 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.45 
 
 		 846 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  46.23 
 
 		 812 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  47.12 
 
 		 609 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.8 
 
 		 998 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  55.68 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.54 
 
 		 666 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  48.54 
 
 		 442 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  44.86 
 
 		 851 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 906 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.46 
 
 		 479 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50 
 
 		 767 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  50.49 
 
 		 580 aa  101  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  51.09 
 
 		 1209 aa  101  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  52.17 
 
 		 403 aa  101  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  51.09 
 
 		 763 aa  100  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46.3 
 
 		 934 aa  100  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  44.04 
 
 		 880 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  48.8 
 
 		 938 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 854 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  64.58 
 
 		 622 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  47.06 
 
 		 681 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.23 
 
 		 505 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 913 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.49 
 
 		 979 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 633 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  46.23 
 
 		 533 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 420 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  48.04 
 
 		 429 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 894 aa  97.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  48.91 
 
 		 487 aa  97.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.69 
 
 		 514 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  43.27 
 
 		 864 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  41.21 
 
 		 608 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  54.88 
 
 		 353 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.57 
 
 		 774 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  46.6 
 
 		 589 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  26.96 
 
 		 484 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  53.57 
 
 		 1298 aa  94.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  55 
 
 		 1137 aa  95.1  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 1128 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  67.44 
 
 		 884 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  42.61 
 
 		 620 aa  94.7  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  44.55 
 
 		 842 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  66.27 
 
 		 962 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.6 
 
 		 499 aa  94  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  48.6 
 
 		 785 aa  94  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  49.46 
 
 		 448 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.66 
 
 		 794 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  45.65 
 
 		 562 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  28.04 
 
 		 634 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  48.04 
 
 		 432 aa  92  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 963 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  24.02 
 
 		 485 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  45.9 
 
 		 847 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.83 
 
 		 743 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>