239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3222 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  100 
 
 		 673 aa  1359    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  59.13 
 
 		 702 aa  624  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  50.19 
 
 		 621 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3459  Spore coat protein CotH  31.49 
 
 		 545 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4911  Spore coat protein CotH  25.93 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303258  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  28.21 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  61 
 
 		 449 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  59.38 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  51.33 
 
 		 451 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  56.18 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  50.51 
 
 		 474 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  50.5 
 
 		 593 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  55.06 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  55.06 
 
 		 422 aa  98.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  56.47 
 
 		 479 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  48.45 
 
 		 354 aa  97.4  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  50 
 
 		 441 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  47.12 
 
 		 493 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  59.6 
 
 		 454 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  52.08 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  51.61 
 
 		 460 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.57 
 
 		 437 aa  94  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  52.27 
 
 		 459 aa  93.6  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  53.66 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  51 
 
 		 448 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  46.15 
 
 		 485 aa  90.9  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  49.49 
 
 		 847 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  48.96 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  49.48 
 
 		 743 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  44.9 
 
 		 562 aa  88.6  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  46.32 
 
 		 372 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  47.78 
 
 		 744 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.81 
 
 		 499 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  44.9 
 
 		 773 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.83 
 
 		 925 aa  87.8  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  42.31 
 
 		 681 aa  87.4  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  47 
 
 		 763 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  45.28 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  50 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.88 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  43.12 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  47.96 
 
 		 678 aa  84.7  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  52.17 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  50.56 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  48.84 
 
 		 495 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  47.96 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 1209 aa  82.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  47.87 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.37 
 
 		 743 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.67 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  45.54 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  44.04 
 
 		 608 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  55.56 
 
 		 543 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  23.37 
 
 		 1805 aa  80.5  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  55.42 
 
 		 457 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  45.05 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 913 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  51.72 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  37.37 
 
 		 854 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  42.39 
 
 		 746 aa  78.2  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 1121 aa  77.8  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  45.83 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  47.42 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  52.43 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  43.48 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.22 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  45.05 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  48.89 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.76 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.18 
 
 		 846 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.76 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  48.19 
 
 		 1137 aa  75.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  43.48 
 
 		 669 aa  75.1  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 906 aa  75.1  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  43.53 
 
 		 792 aa  75.1  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  46.24 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  47.19 
 
 		 1298 aa  74.7  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  36.67 
 
 		 842 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  52.05 
 
 		 359 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  51.14 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.02 
 
 		 609 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  44.9 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  44.09 
 
 		 973 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.39 
 
 		 491 aa  72  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  49.44 
 
 		 89 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.65 
 
 		 580 aa  72  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  46.15 
 
 		 978 aa  72  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.56 
 
 		 590 aa  71.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  44.58 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  40.66 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43.37 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.76 
 
 		 984 aa  70.5  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  47.25 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  42.72 
 
 		 880 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  39.81 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>