24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1553 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  983    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3459  Spore coat protein CotH  29.84 
 
 
545 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4911  Spore coat protein CotH  30 
 
 
518 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303258  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  28.21 
 
 
673 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  28.01 
 
 
702 aa  156  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  27.46 
 
 
621 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  24.33 
 
 
1805 aa  77.4  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  30 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  21.96 
 
 
569 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  35.79 
 
 
358 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  35.79 
 
 
368 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  20.44 
 
 
361 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  25.35 
 
 
611 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  35.79 
 
 
358 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  35.79 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  35.79 
 
 
358 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  35.79 
 
 
358 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  35.79 
 
 
358 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  35.79 
 
 
358 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  35.79 
 
 
358 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  35.79 
 
 
358 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  34.74 
 
 
358 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  34.65 
 
 
538 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  23.18 
 
 
485 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>