43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0475 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  100 
 
 
569 aa  1156    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  24.74 
 
 
364 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  25.61 
 
 
358 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  25.5 
 
 
368 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  25.5 
 
 
358 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  25.5 
 
 
368 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  25.5 
 
 
358 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  25.5 
 
 
358 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  27.3 
 
 
361 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  25.17 
 
 
358 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  25.62 
 
 
358 aa  94  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  24.32 
 
 
358 aa  94  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  25.17 
 
 
358 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  24.14 
 
 
358 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  32.43 
 
 
610 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  25.57 
 
 
500 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.11 
 
 
533 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1128  hypothetical protein  24.48 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4911  Spore coat protein CotH  24.03 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303258  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  26.01 
 
 
835 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  25.48 
 
 
485 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  23.27 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  20.55 
 
 
611 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  26.85 
 
 
564 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3461  Spore coat protein CotH  25.4 
 
 
557 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0390465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3397  Spore coat protein CotH  25.4 
 
 
557 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  26.15 
 
 
819 aa  60.8  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  25.24 
 
 
567 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4920  Spore coat assembly protein-like protein  26.97 
 
 
544 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  34.65 
 
 
400 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  21.6 
 
 
659 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3317  spore coat assembly protein-like  25.2 
 
 
557 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  24.92 
 
 
702 aa  53.9  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3459  Spore coat protein CotH  23.51 
 
 
545 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  21.96 
 
 
477 aa  53.9  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  31.48 
 
 
709 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3379  spore coat protein CotH  24.19 
 
 
505 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  23.64 
 
 
1805 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  32.98 
 
 
490 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  26.81 
 
 
679 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  25.42 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  21.99 
 
 
673 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  27.01 
 
 
679 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>