41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  100 
 
 
485 aa  998    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  33.27 
 
 
679 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  33.89 
 
 
611 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  31.14 
 
 
663 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  30.55 
 
 
538 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  30.42 
 
 
659 aa  237  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  33.2 
 
 
679 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  37.55 
 
 
709 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  26.85 
 
 
536 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.6 
 
 
533 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  27.38 
 
 
564 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  23.82 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  25.78 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  24.04 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  27.76 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  25.44 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  25.44 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  25.44 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  25.44 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  25.44 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  26.12 
 
 
538 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  24.04 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  25.44 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  25.44 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  23.28 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  25 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  22.45 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  25.19 
 
 
400 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  25.48 
 
 
569 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  23.49 
 
 
819 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3062  Spore coat protein CotH  25.57 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  22.73 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4920  Spore coat assembly protein-like protein  23.53 
 
 
544 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  25.78 
 
 
661 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3397  Spore coat protein CotH  27.59 
 
 
557 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3461  Spore coat protein CotH  27.59 
 
 
557 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0390465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3453  Spore coat protein CotH  25.52 
 
 
798 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0950404  normal  0.13091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  22.94 
 
 
610 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  23.18 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3317  spore coat assembly protein-like  24.41 
 
 
557 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1817  Spore coat protein CotH  35.71 
 
 
548 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.572718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>