28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6689 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  100 
 
 
500 aa  1026    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  27.11 
 
 
364 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  25.84 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  24.64 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  24.64 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  24.64 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  24.64 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  24.64 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  25.84 
 
 
358 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  24.92 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  25.84 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  24.92 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  23.01 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  25.57 
 
 
569 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  23.13 
 
 
567 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  22.82 
 
 
835 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  22 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1128  hypothetical protein  21.78 
 
 
367 aa  54.7  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  22.95 
 
 
819 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3379  spore coat protein CotH  21.53 
 
 
505 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  20.4 
 
 
611 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  20.48 
 
 
564 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  24.14 
 
 
495 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3876  hypothetical protein  21.03 
 
 
947 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3459  Spore coat protein CotH  20.16 
 
 
545 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  32.95 
 
 
536 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  20.61 
 
 
533 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4911  Spore coat protein CotH  19.95 
 
 
518 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303258  normal  0.07038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>