22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0251 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  100 
 
 
679 aa  1391    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  44.03 
 
 
663 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  39.24 
 
 
679 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  39.46 
 
 
709 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  48.37 
 
 
538 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  37.63 
 
 
659 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  40.14 
 
 
611 aa  308  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  33.08 
 
 
485 aa  272  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  30.81 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  31.88 
 
 
564 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  25.75 
 
 
536 aa  71.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.27 
 
 
533 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  29.41 
 
 
538 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  22.47 
 
 
567 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3062  Spore coat protein CotH  33.66 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  29.51 
 
 
661 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1817  Spore coat protein CotH  33.65 
 
 
548 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  27.48 
 
 
569 aa  47.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4920  Spore coat assembly protein-like protein  30 
 
 
544 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  24.72 
 
 
490 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  34.92 
 
 
819 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  23.48 
 
 
477 aa  44.7  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>