43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1405 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  100 
 
 
709 aa  1452    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  41.13 
 
 
679 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  39.11 
 
 
679 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  35.76 
 
 
663 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  42.43 
 
 
611 aa  282  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  56.31 
 
 
538 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  35.66 
 
 
659 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  34.17 
 
 
485 aa  147  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  39.86 
 
 
564 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.41 
 
 
533 aa  92.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  30.88 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  25.9 
 
 
536 aa  80.1  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  25.77 
 
 
567 aa  79  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3062  Spore coat protein CotH  32.46 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  27.17 
 
 
538 aa  63.9  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  26.79 
 
 
953 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4674  cell surface protein  27.68 
 
 
939 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0699989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  40.26 
 
 
1977 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  26.67 
 
 
358 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  26.83 
 
 
358 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  33.64 
 
 
358 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  24.4 
 
 
358 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  32.71 
 
 
368 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  31.78 
 
 
368 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  20.17 
 
 
661 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  31.78 
 
 
358 aa  52  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  31.78 
 
 
358 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  31.78 
 
 
358 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  31.78 
 
 
358 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07671  hypothetical protein  33.01 
 
 
872 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  23.47 
 
 
364 aa  50.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  22.69 
 
 
819 aa  50.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4920  Spore coat assembly protein-like protein  27.27 
 
 
544 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  31.48 
 
 
569 aa  50.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4661  cell surface protein  27.37 
 
 
907 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  29.81 
 
 
240 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  31.43 
 
 
358 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  34.78 
 
 
746 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  29.63 
 
 
258 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  30.47 
 
 
490 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  32.81 
 
 
446 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  23.93 
 
 
400 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1817  Spore coat protein CotH  31.65 
 
 
548 aa  47.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.572718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>