47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2923 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  100 
 
 
746 aa  1473    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2598  hypothetical protein  80.93 
 
 
369 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  55.79 
 
 
3242 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  53.7 
 
 
3392 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  41.12 
 
 
1977 aa  92.4  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16331  hypothetical protein  57.73 
 
 
190 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.377957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  47.74 
 
 
971 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  61.4 
 
 
913 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.59 
 
 
2313 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0783  hypothetical protein  54.95 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.024345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  24.38 
 
 
1314 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  27.36 
 
 
1024 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  51.52 
 
 
1197 aa  72  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  44.76 
 
 
969 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  44.76 
 
 
969 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  35.75 
 
 
1088 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 
657 aa  68.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  27.38 
 
 
1017 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  33.7 
 
 
1126 aa  64.7  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1331  hypothetical protein  60 
 
 
247 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  29.36 
 
 
1128 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.43 
 
 
14916 aa  57.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  34.57 
 
 
682 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4013  hypothetical protein  57.63 
 
 
244 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012412  hitchhiker  0.000000000204146 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  40.21 
 
 
794 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  45.9 
 
 
1859 aa  54.7  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.07 
 
 
2449 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.71 
 
 
1888 aa  51.6  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  40.94 
 
 
1508 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  30.4 
 
 
709 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  43.33 
 
 
570 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  26.44 
 
 
2622 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
600 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1298  hypothetical protein  20.24 
 
 
597 aa  48.5  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  25.84 
 
 
2004 aa  48.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  45.45 
 
 
230 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0607  surface protein  33.87 
 
 
414 aa  47.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.31 
 
 
2397 aa  47  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  34.48 
 
 
953 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  30.43 
 
 
684 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  40 
 
 
1112 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  32 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  39.09 
 
 
3409 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.17 
 
 
2179 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  22 
 
 
718 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  51.19 
 
 
542 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0008  hypothetical protein  30.17 
 
 
429 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>