More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5637 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  64.39 
 
 
900 aa  892    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  78.92 
 
 
836 aa  1111    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  64.39 
 
 
905 aa  893    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  75.04 
 
 
837 aa  1057    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  64.23 
 
 
897 aa  898    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  74 
 
 
837 aa  1044    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  64.39 
 
 
896 aa  892    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  74.29 
 
 
846 aa  1040    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  64.39 
 
 
897 aa  892    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  74.59 
 
 
834 aa  1044    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  64.24 
 
 
897 aa  892    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  74.74 
 
 
835 aa  1050    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  64.45 
 
 
647 aa  872    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  63.64 
 
 
865 aa  894    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  64.39 
 
 
897 aa  892    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  74.29 
 
 
820 aa  1041    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  63.11 
 
 
914 aa  904    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  74.89 
 
 
834 aa  1049    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  75.78 
 
 
830 aa  1065    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  73.01 
 
 
839 aa  1075    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  64.39 
 
 
897 aa  892    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  75.19 
 
 
832 aa  1055    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
794 aa  1633    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  49.39 
 
 
912 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  46.49 
 
 
901 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.57 
 
 
791 aa  452  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  39.3 
 
 
754 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  36.61 
 
 
773 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  37.2 
 
 
750 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  37.71 
 
 
765 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.67 
 
 
730 aa  391  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.71 
 
 
727 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
727 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
727 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.59 
 
 
879 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.42 
 
 
623 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  35.28 
 
 
743 aa  365  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  36.97 
 
 
828 aa  364  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.14 
 
 
761 aa  359  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 
795 aa  350  8e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.62 
 
 
727 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.71 
 
 
905 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.79 
 
 
709 aa  347  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  35.38 
 
 
880 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  35.73 
 
 
679 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  35.09 
 
 
667 aa  328  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  34.94 
 
 
680 aa  326  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  34.78 
 
 
680 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  34.93 
 
 
680 aa  325  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  34.79 
 
 
679 aa  324  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.62 
 
 
680 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  34.62 
 
 
673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  34.62 
 
 
673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  34.27 
 
 
680 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  34.74 
 
 
814 aa  320  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  34.69 
 
 
680 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 
706 aa  317  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  34.13 
 
 
705 aa  317  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  34.13 
 
 
705 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  34.13 
 
 
705 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  34.13 
 
 
705 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  35.41 
 
 
705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  33.97 
 
 
705 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  33.97 
 
 
705 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  31.99 
 
 
638 aa  313  7.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  34.49 
 
 
746 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  33.86 
 
 
705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  33.81 
 
 
705 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  34.19 
 
 
746 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.94 
 
 
776 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 
830 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.54 
 
 
712 aa  302  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 
806 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  33.19 
 
 
820 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
646 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  32.85 
 
 
658 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  35.61 
 
 
829 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
626 aa  297  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  32.56 
 
 
755 aa  294  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.76 
 
 
687 aa  294  5e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.22 
 
 
648 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 
824 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  33.74 
 
 
773 aa  291  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 
713 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 
713 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 
713 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
766 aa  290  7e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  34.17 
 
 
714 aa  290  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.76 
 
 
734 aa  289  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  32.78 
 
 
679 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.58 
 
 
732 aa  289  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
721 aa  289  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.9 
 
 
661 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  34.25 
 
 
778 aa  287  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  32.58 
 
 
707 aa  287  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.22 
 
 
713 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.22 
 
 
713 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.22 
 
 
713 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  33.28 
 
 
775 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.04 
 
 
618 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>