More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0432 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  79.2 
 
 
709 aa  1054    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  99.72 
 
 
713 aa  1418    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  77.88 
 
 
714 aa  1015    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  99.72 
 
 
713 aa  1418    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
713 aa  1424    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  77.34 
 
 
707 aa  1082    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  79.14 
 
 
709 aa  1052    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  78.67 
 
 
714 aa  1047    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  90.76 
 
 
710 aa  1255    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  99.72 
 
 
713 aa  1418    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  78.84 
 
 
705 aa  1050    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
713 aa  1424    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
713 aa  1424    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  79.14 
 
 
709 aa  1052    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  50.81 
 
 
679 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  49.51 
 
 
687 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.9 
 
 
646 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 
667 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  39.02 
 
 
662 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  38.93 
 
 
693 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  36.57 
 
 
641 aa  372  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.66 
 
 
656 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  49.6 
 
 
773 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.35 
 
 
751 aa  365  1e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  36.06 
 
 
806 aa  364  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.32 
 
 
645 aa  363  5.0000000000000005e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  34.29 
 
 
642 aa  361  3e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  37.78 
 
 
704 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.96 
 
 
712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.36 
 
 
654 aa  357  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  35.11 
 
 
642 aa  355  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 
750 aa  350  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.08 
 
 
744 aa  349  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.48 
 
 
727 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.36 
 
 
776 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 
770 aa  347  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  33.54 
 
 
774 aa  347  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  36.55 
 
 
701 aa  347  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 
760 aa  346  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.16 
 
 
643 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.11 
 
 
655 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.16 
 
 
643 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
720 aa  345  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.7 
 
 
714 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.39 
 
 
640 aa  344  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.44 
 
 
727 aa  343  9e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  35.38 
 
 
755 aa  341  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 
727 aa  342  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.63 
 
 
661 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  38.7 
 
 
728 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  35.07 
 
 
730 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.52 
 
 
643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.12 
 
 
618 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.08 
 
 
752 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.35 
 
 
762 aa  337  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  47.86 
 
 
766 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.56 
 
 
811 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.98 
 
 
648 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  37.02 
 
 
640 aa  333  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.29 
 
 
714 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 
710 aa  332  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.97 
 
 
730 aa  330  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 
643 aa  330  8e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 
643 aa  329  9e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 
643 aa  329  9e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.81 
 
 
763 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  37.98 
 
 
732 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  34.52 
 
 
644 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.77 
 
 
727 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.51 
 
 
638 aa  325  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.96 
 
 
648 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  35.09 
 
 
658 aa  325  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  38.39 
 
 
827 aa  323  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.75 
 
 
649 aa  323  6e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  38.31 
 
 
827 aa  323  9.000000000000001e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.32 
 
 
625 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  37.24 
 
 
728 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  34.8 
 
 
880 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  33.01 
 
 
676 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  37.95 
 
 
723 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  45.95 
 
 
801 aa  321  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.61 
 
 
734 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 
755 aa  320  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 
766 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.78 
 
 
683 aa  320  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  44.86 
 
 
777 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 
775 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.42 
 
 
739 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.28 
 
 
683 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  36.99 
 
 
712 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  44.86 
 
 
777 aa  318  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.28 
 
 
683 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  36.03 
 
 
833 aa  317  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.85 
 
 
779 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  32.94 
 
 
683 aa  317  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.85 
 
 
776 aa  317  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  33.11 
 
 
683 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  33.11 
 
 
683 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  35.48 
 
 
720 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.61 
 
 
761 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>