More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0135 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
646 aa  1318    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.3 
 
 
648 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 
667 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  38.94 
 
 
641 aa  420  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.04 
 
 
661 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  38.81 
 
 
713 aa  417  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  38.14 
 
 
693 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  38.32 
 
 
662 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  37.15 
 
 
704 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 
806 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  39.33 
 
 
679 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  39.37 
 
 
687 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  40.23 
 
 
751 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.53 
 
 
649 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.52 
 
 
744 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  37.44 
 
 
701 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.9 
 
 
648 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.31 
 
 
626 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  39.9 
 
 
713 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  39.9 
 
 
713 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.18 
 
 
640 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.52 
 
 
776 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  39.9 
 
 
713 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  39.22 
 
 
713 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  39.22 
 
 
713 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  34.91 
 
 
668 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  38.79 
 
 
811 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  39.22 
 
 
713 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  38.6 
 
 
707 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.68 
 
 
643 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.68 
 
 
643 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.03 
 
 
765 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  38.57 
 
 
755 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 
709 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 
709 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.08 
 
 
656 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  38.65 
 
 
714 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.97 
 
 
734 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  39.39 
 
 
709 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.44 
 
 
712 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.16 
 
 
774 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  38.63 
 
 
714 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  39.04 
 
 
705 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  35.03 
 
 
750 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  39.16 
 
 
710 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.09 
 
 
618 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  34.94 
 
 
642 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.03 
 
 
761 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.17 
 
 
643 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.69 
 
 
640 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  38.02 
 
 
683 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 
757 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  38.73 
 
 
683 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  38.73 
 
 
683 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  37.73 
 
 
683 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  37.9 
 
 
683 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  36.42 
 
 
755 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  37.9 
 
 
683 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  37.73 
 
 
683 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 
727 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.96 
 
 
681 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  35.49 
 
 
645 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  35.57 
 
 
642 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.11 
 
 
655 aa  365  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 
683 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  37.56 
 
 
683 aa  364  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  37.56 
 
 
683 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  37.4 
 
 
683 aa  363  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.51 
 
 
714 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39 
 
 
775 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  38.31 
 
 
824 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.72 
 
 
654 aa  361  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 
779 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.42 
 
 
761 aa  361  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 
625 aa  360  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  37.98 
 
 
776 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  38.31 
 
 
824 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.12 
 
 
770 aa  360  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  39.1 
 
 
714 aa  359  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  38.81 
 
 
732 aa  359  9e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  35.48 
 
 
644 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  38.96 
 
 
720 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.62 
 
 
833 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.74 
 
 
727 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 
665 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  37.12 
 
 
683 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.6 
 
 
728 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  39.56 
 
 
739 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 
828 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.36 
 
 
735 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  39.33 
 
 
709 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  38.4 
 
 
766 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.5 
 
 
752 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 
730 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  34.08 
 
 
638 aa  353  5.9999999999999994e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 
654 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.97 
 
 
734 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  33.9 
 
 
643 aa  351  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  39.8 
 
 
651 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.12 
 
 
730 aa  349  9e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>