More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4417 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  53.07 
 
 		 728 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  95.9 
 
 		 776 aa  1444    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  50.78 
 
 		 727 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  56.37 
 
 		 763 aa  814    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  50.93 
 
 		 720 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  51.08 
 
 		 714 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  59.43 
 
 		 833 aa  936    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  57.01 
 
 		 730 aa  786    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  51.64 
 
 		 734 aa  665    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 779 aa  1583    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  47.69 
 
 		 739 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  50.99 
 
 		 728 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  68.28 
 
 		 750 aa  973    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  50.07 
 
 		 735 aa  671    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  56.61 
 
 		 770 aa  837    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  54.05 
 
 		 757 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  49.33 
 
 		 734 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  51.05 
 
 		 720 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  52.62 
 
 		 732 aa  678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  51.81 
 
 		 714 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  54.97 
 
 		 723 aa  795    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  55.81 
 
 		 712 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  50.71 
 
 		 727 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  49.56 
 
 		 741 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  48.47 
 
 		 775 aa  571  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  48.01 
 
 		 651 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  45.87 
 
 		 654 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  47.55 
 
 		 669 aa  499  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  40.87 
 
 		 718 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  42.46 
 
 		 724 aa  479  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  43.8 
 
 		 712 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  40.71 
 
 		 724 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  40.17 
 
 		 788 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 		 831 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  42.01 
 
 		 714 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  42.97 
 
 		 707 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  43.42 
 
 		 768 aa  466  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  40.32 
 
 		 759 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  40.16 
 
 		 718 aa  462  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  41.74 
 
 		 757 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  46.22 
 
 		 656 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  42.99 
 
 		 769 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  42.4 
 
 		 750 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  44.52 
 
 		 691 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  45.7 
 
 		 796 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  41.48 
 
 		 765 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  41.48 
 
 		 784 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  42.53 
 
 		 760 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  42.01 
 
 		 788 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  39.87 
 
 		 758 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  41.99 
 
 		 764 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  41.3 
 
 		 760 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  39.44 
 
 		 742 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  39.49 
 
 		 735 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  41.33 
 
 		 744 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  42.75 
 
 		 759 aa  445  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  42.03 
 
 		 743 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  42.41 
 
 		 729 aa  438  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  45.18 
 
 		 810 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  43.07 
 
 		 658 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  42.79 
 
 		 728 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  42.79 
 
 		 736 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  40.13 
 
 		 709 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  42.41 
 
 		 763 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  42 
 
 		 815 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  42.05 
 
 		 733 aa  419  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  43.09 
 
 		 750 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  43.32 
 
 		 626 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  41.13 
 
 		 732 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  44.55 
 
 		 814 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  42.44 
 
 		 830 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  44.36 
 
 		 727 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.77 
 
 		 776 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  42.28 
 
 		 830 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40.6 
 
 		 712 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 		 755 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  41.15 
 
 		 776 aa  409  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  42.91 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.6 
 
 		 712 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  42.78 
 
 		 824 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  39.14 
 
 		 648 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  42.83 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  42.6 
 
 		 824 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  42.91 
 
 		 618 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  39.82 
 
 		 626 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  38.11 
 
 		 744 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  41.79 
 
 		 643 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  42.59 
 
 		 643 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  42.59 
 
 		 643 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  41.37 
 
 		 699 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 		 811 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  42.13 
 
 		 640 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  41.95 
 
 		 625 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  41.42 
 
 		 640 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 		 661 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  40.75 
 
 		 751 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.09 
 
 		 646 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  38.43 
 
 		 680 aa  362  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  39.73 
 
 		 761 aa  360  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  37.26 
 
 		 765 aa  357  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>