More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0220 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
643 aa  1318    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  62.62 
 
 
640 aa  839    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  63.37 
 
 
618 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  63.71 
 
 
640 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  56.74 
 
 
625 aa  694    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
643 aa  1318    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  63.05 
 
 
654 aa  817    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  76.98 
 
 
643 aa  1042    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  43.11 
 
 
648 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  43.46 
 
 
811 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  41.3 
 
 
751 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  42.4 
 
 
776 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  39.97 
 
 
648 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.39 
 
 
765 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  44.79 
 
 
712 aa  422  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  40.54 
 
 
806 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  41.04 
 
 
905 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  41.06 
 
 
761 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  43.54 
 
 
824 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  43.28 
 
 
824 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.97 
 
 
661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  41.7 
 
 
714 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.5 
 
 
714 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  40.42 
 
 
681 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  40.55 
 
 
755 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  39.29 
 
 
761 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.29 
 
 
649 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.96 
 
 
646 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  39.29 
 
 
642 aa  388  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.03 
 
 
728 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  42.59 
 
 
779 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  42.59 
 
 
776 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  38.61 
 
 
642 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  40.23 
 
 
728 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  39.8 
 
 
727 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.67 
 
 
770 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.37 
 
 
775 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  37.82 
 
 
683 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  38.73 
 
 
683 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  39.08 
 
 
693 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.27 
 
 
727 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 
727 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  40.6 
 
 
730 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  37.65 
 
 
683 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  38.18 
 
 
828 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  40.43 
 
 
763 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  37.74 
 
 
683 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  37.65 
 
 
683 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  37.65 
 
 
683 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  37.91 
 
 
683 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  37.48 
 
 
683 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  37.74 
 
 
683 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  37.63 
 
 
655 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.46 
 
 
732 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  37.74 
 
 
683 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.8 
 
 
626 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  37.31 
 
 
683 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  38.68 
 
 
667 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  37.48 
 
 
683 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  40.38 
 
 
654 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  38.2 
 
 
658 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  37.19 
 
 
679 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 
727 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  37.99 
 
 
708 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 
795 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  37.63 
 
 
638 aa  365  1e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  41.92 
 
 
750 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  41.16 
 
 
750 aa  365  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 
668 aa  364  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.57 
 
 
704 aa  364  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  37.9 
 
 
710 aa  363  5.0000000000000005e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  36.85 
 
 
687 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  37.54 
 
 
662 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  40.22 
 
 
723 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  39.23 
 
 
833 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  38.89 
 
 
720 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.69 
 
 
734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  37.17 
 
 
641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.68 
 
 
656 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  37.94 
 
 
734 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  37.06 
 
 
801 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.06 
 
 
751 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.03 
 
 
692 aa  353  5e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 
669 aa  353  7e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  37.52 
 
 
680 aa  352  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 
643 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  36.48 
 
 
732 aa  350  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  34.9 
 
 
713 aa  350  5e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  36.68 
 
 
735 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  37.16 
 
 
757 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  37.02 
 
 
720 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  36.33 
 
 
643 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.79 
 
 
744 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  38.34 
 
 
860 aa  349  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 
676 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  36.33 
 
 
643 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  37.14 
 
 
829 aa  349  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.72 
 
 
645 aa  349  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.68 
 
 
739 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  40.29 
 
 
796 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>