More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0536 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
643 aa  1320    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  75.47 
 
 
644 aa  1018    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  97.51 
 
 
643 aa  1288    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  49.46 
 
 
655 aa  644    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  58.12 
 
 
642 aa  771    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  58.76 
 
 
642 aa  772    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  56.7 
 
 
638 aa  750    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  56.62 
 
 
641 aa  748    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
643 aa  1320    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  60.79 
 
 
645 aa  787    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.95 
 
 
618 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  35.21 
 
 
640 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.63 
 
 
640 aa  362  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.08 
 
 
643 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36 
 
 
654 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.84 
 
 
751 aa  350  6e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.33 
 
 
643 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.33 
 
 
643 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  36.26 
 
 
806 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.73 
 
 
646 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.08 
 
 
625 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.12 
 
 
679 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.62 
 
 
709 aa  339  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
709 aa  339  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
709 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.58 
 
 
661 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.86 
 
 
761 aa  334  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.39 
 
 
707 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.34 
 
 
648 aa  332  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.92 
 
 
712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
714 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.04 
 
 
705 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.19 
 
 
693 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 
776 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  33.05 
 
 
687 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  33.69 
 
 
714 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.19 
 
 
665 aa  320  6e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  34.53 
 
 
691 aa  320  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  33.57 
 
 
710 aa  318  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.52 
 
 
727 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.99 
 
 
755 aa  317  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.06 
 
 
905 aa  317  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  37.08 
 
 
796 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.7 
 
 
765 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.97 
 
 
824 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.97 
 
 
824 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.68 
 
 
658 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.68 
 
 
649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  34.04 
 
 
676 aa  310  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
795 aa  310  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  32.71 
 
 
750 aa  309  9e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.06 
 
 
648 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.58 
 
 
727 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 
829 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 
779 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 
662 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.55 
 
 
766 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  37.27 
 
 
810 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.61 
 
 
714 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.04 
 
 
626 aa  303  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  31.11 
 
 
704 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.32 
 
 
741 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.44 
 
 
761 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  34.09 
 
 
667 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  34.88 
 
 
814 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  33.73 
 
 
811 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  32.6 
 
 
656 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  34.4 
 
 
669 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.09 
 
 
680 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  32.81 
 
 
755 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  34.33 
 
 
708 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 
710 aa  300  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.92 
 
 
680 aa  301  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 
705 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.3 
 
 
776 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 
667 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  33.74 
 
 
680 aa  300  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.72 
 
 
775 aa  300  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  33.1 
 
 
705 aa  300  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  34.42 
 
 
768 aa  299  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  33.92 
 
 
673 aa  300  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  33.92 
 
 
673 aa  300  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  33.57 
 
 
680 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 
728 aa  299  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.04 
 
 
656 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.11 
 
 
680 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.45 
 
 
680 aa  298  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 
718 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.55 
 
 
714 aa  297  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.72 
 
 
727 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  32.24 
 
 
730 aa  296  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.78 
 
 
727 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  31.68 
 
 
757 aa  296  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  34.16 
 
 
759 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>