More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2904 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  58.62 
 
 
776 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  59.86 
 
 
824 aa  863    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  53.44 
 
 
755 aa  738    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  54.84 
 
 
824 aa  868    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
811 aa  1659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  54.23 
 
 
626 aa  670    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  54.93 
 
 
712 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  45.76 
 
 
658 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  46.58 
 
 
680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  46.13 
 
 
692 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  42.76 
 
 
602 aa  482  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  43.46 
 
 
643 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  43.46 
 
 
643 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.93 
 
 
750 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.68 
 
 
751 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.86 
 
 
751 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.16 
 
 
762 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  44.75 
 
 
734 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  42.52 
 
 
734 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  42.26 
 
 
732 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  43.36 
 
 
751 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  40.04 
 
 
643 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  40.03 
 
 
770 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  38.43 
 
 
648 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  40.86 
 
 
739 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  42.91 
 
 
735 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  39.89 
 
 
741 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  42.36 
 
 
720 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  40.97 
 
 
775 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.38 
 
 
618 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 
723 aa  392  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  41.45 
 
 
654 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  39.2 
 
 
720 aa  392  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.07 
 
 
646 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.86 
 
 
714 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  39.07 
 
 
640 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  37.95 
 
 
756 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.77 
 
 
757 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  38.82 
 
 
806 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  39.23 
 
 
714 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 
730 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  39.53 
 
 
763 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  38.45 
 
 
683 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  41.93 
 
 
661 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  39.67 
 
 
727 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  39.67 
 
 
727 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  38.12 
 
 
683 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  38.74 
 
 
728 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  38.12 
 
 
683 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  39.5 
 
 
728 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  38.12 
 
 
683 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  39.79 
 
 
625 aa  382  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  38.12 
 
 
683 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  38.67 
 
 
683 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  41.52 
 
 
712 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  39.44 
 
 
640 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  38.16 
 
 
683 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  37.79 
 
 
683 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  38.16 
 
 
683 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.36 
 
 
833 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  40.2 
 
 
763 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 
779 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 
776 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  38.12 
 
 
683 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 
683 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.62 
 
 
681 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  41.99 
 
 
757 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  41.79 
 
 
648 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  38.47 
 
 
740 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  41.12 
 
 
626 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 
683 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  39.21 
 
 
751 aa  365  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.89 
 
 
761 aa  365  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 
656 aa  363  7.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  40.18 
 
 
796 aa  363  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  39.09 
 
 
658 aa  361  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  40.18 
 
 
651 aa  360  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  37.81 
 
 
759 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  38.89 
 
 
760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  38.52 
 
 
691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  39.93 
 
 
710 aa  356  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.69 
 
 
649 aa  355  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  38.78 
 
 
709 aa  355  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  38 
 
 
712 aa  353  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  35.61 
 
 
760 aa  352  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.84 
 
 
761 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  40.43 
 
 
654 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.66 
 
 
693 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  35.3 
 
 
718 aa  352  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  35.86 
 
 
677 aa  352  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  38.18 
 
 
757 aa  351  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  37.9 
 
 
750 aa  350  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  40.04 
 
 
667 aa  350  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  34.17 
 
 
759 aa  350  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 
758 aa  350  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  39.26 
 
 
810 aa  349  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  37.5 
 
 
732 aa  349  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 
704 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  33.2 
 
 
768 aa  347  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 
750 aa  347  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>