More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0767 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
763 aa  1548    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  90.73 
 
 
626 aa  1164    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  68.31 
 
 
658 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  50 
 
 
796 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  48.85 
 
 
810 aa  479  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  47.58 
 
 
775 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  48.38 
 
 
727 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  49.07 
 
 
814 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  47.77 
 
 
815 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  45.82 
 
 
830 aa  446  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  48.52 
 
 
750 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  45.99 
 
 
830 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  45.39 
 
 
699 aa  445  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  46.79 
 
 
651 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  42.98 
 
 
739 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  47.57 
 
 
626 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  45.07 
 
 
720 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  44.08 
 
 
741 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  42.98 
 
 
735 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  44.35 
 
 
734 aa  426  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  44.08 
 
 
691 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  43.66 
 
 
734 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  41.46 
 
 
720 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  46.72 
 
 
757 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  42.93 
 
 
732 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  41.92 
 
 
833 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  44.46 
 
 
712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  41.82 
 
 
714 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  43.43 
 
 
714 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  44.09 
 
 
779 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  43.73 
 
 
776 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  43.57 
 
 
728 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  44.16 
 
 
656 aa  402  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  43.38 
 
 
727 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  43.38 
 
 
727 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  42.96 
 
 
728 aa  399  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  41.89 
 
 
770 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40.07 
 
 
712 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  43.57 
 
 
763 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  42.06 
 
 
750 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  43.57 
 
 
730 aa  389  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  38.57 
 
 
718 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  41.09 
 
 
759 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  42.88 
 
 
723 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  41.99 
 
 
669 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  42.11 
 
 
712 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  41.7 
 
 
769 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  40.7 
 
 
757 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  41.06 
 
 
750 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  37.76 
 
 
732 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  36.98 
 
 
742 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  40.37 
 
 
811 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  40.88 
 
 
776 aa  376  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  40.72 
 
 
729 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  41.05 
 
 
760 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  37.64 
 
 
768 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  39.82 
 
 
758 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  40.14 
 
 
718 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  38.7 
 
 
709 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  40.31 
 
 
724 aa  372  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  41.57 
 
 
714 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  38.54 
 
 
759 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  40.5 
 
 
831 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  40.98 
 
 
724 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  40.66 
 
 
788 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  40.17 
 
 
788 aa  363  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  41.14 
 
 
776 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  39.96 
 
 
654 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  40.41 
 
 
735 aa  360  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  36.86 
 
 
760 aa  360  7e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  40.93 
 
 
707 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  36.57 
 
 
744 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  38 
 
 
784 aa  353  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  38 
 
 
765 aa  353  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  40.85 
 
 
733 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.48 
 
 
626 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  38.35 
 
 
824 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  38.35 
 
 
824 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  38.31 
 
 
755 aa  346  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  36.01 
 
 
743 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  41.22 
 
 
728 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.04 
 
 
712 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  40.1 
 
 
744 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  36.39 
 
 
764 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  40.57 
 
 
736 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  39.89 
 
 
643 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  39.89 
 
 
643 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  40.53 
 
 
643 aa  330  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.04 
 
 
727 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  40.08 
 
 
654 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38 
 
 
761 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  39.62 
 
 
618 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  38.29 
 
 
680 aa  320  7e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.56 
 
 
646 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  38.31 
 
 
757 aa  317  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.76 
 
 
648 aa  316  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 
668 aa  316  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  38.21 
 
 
658 aa  315  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  35.92 
 
 
750 aa  307  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 
648 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>