More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1574 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  60.63 
 
 
602 aa  767    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
692 aa  1410    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  75.68 
 
 
680 aa  1020    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  69.05 
 
 
658 aa  927    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  51.39 
 
 
712 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  46.89 
 
 
776 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  46.48 
 
 
755 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  46.7 
 
 
824 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  46.7 
 
 
824 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  45.94 
 
 
626 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  45.44 
 
 
811 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  39.18 
 
 
589 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  38.38 
 
 
589 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  38.19 
 
 
589 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  38.58 
 
 
589 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  40.34 
 
 
739 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  40.52 
 
 
735 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.53 
 
 
734 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  40.28 
 
 
720 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  37.56 
 
 
806 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.3 
 
 
640 aa  361  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.93 
 
 
618 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.29 
 
 
732 aa  360  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.35 
 
 
734 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  37.14 
 
 
640 aa  358  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 
768 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 
643 aa  357  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  37.83 
 
 
775 aa  356  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  38.7 
 
 
741 aa  356  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.45 
 
 
727 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.4 
 
 
643 aa  356  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.4 
 
 
643 aa  356  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  39.93 
 
 
718 aa  356  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  36.22 
 
 
732 aa  355  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  38.46 
 
 
727 aa  350  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.06 
 
 
770 aa  350  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  39.82 
 
 
761 aa  349  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  38.88 
 
 
654 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  38.9 
 
 
742 aa  345  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  37.7 
 
 
759 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  35.79 
 
 
724 aa  344  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.92 
 
 
751 aa  343  7e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  40.34 
 
 
757 aa  343  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  37.6 
 
 
728 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  37.92 
 
 
759 aa  342  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.57 
 
 
712 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  36.46 
 
 
724 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  37.43 
 
 
760 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  36.46 
 
 
718 aa  340  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  36.95 
 
 
728 aa  339  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 
727 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 
730 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  37.1 
 
 
757 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  36.56 
 
 
758 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 
763 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 
720 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  36.48 
 
 
727 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  37.04 
 
 
779 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  37.56 
 
 
714 aa  337  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.54 
 
 
691 aa  337  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  37.04 
 
 
776 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  36.17 
 
 
769 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 
651 aa  336  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  37.37 
 
 
714 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  36.88 
 
 
750 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
654 aa  333  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.33 
 
 
625 aa  333  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 
733 aa  331  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.54 
 
 
714 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  38.02 
 
 
796 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.16 
 
 
646 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  36.35 
 
 
707 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.87 
 
 
761 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 
750 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  37.61 
 
 
709 aa  327  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.34 
 
 
648 aa  327  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.78 
 
 
649 aa  325  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  38.2 
 
 
712 aa  324  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  36.18 
 
 
833 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 
709 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.9 
 
 
751 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.9 
 
 
751 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 
710 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  35.8 
 
 
760 aa  321  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.25 
 
 
648 aa  320  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  35.63 
 
 
784 aa  320  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  37.39 
 
 
744 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  35.77 
 
 
729 aa  320  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  35.63 
 
 
765 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.52 
 
 
750 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  37.82 
 
 
658 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  39.34 
 
 
830 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  37.73 
 
 
669 aa  318  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  39.15 
 
 
815 aa  317  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  38.37 
 
 
681 aa  317  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  38.47 
 
 
704 aa  317  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  39.34 
 
 
830 aa  317  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.82 
 
 
765 aa  317  7e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 
661 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>