More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0706 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  98.8 
 
 
830 aa  1624    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
830 aa  1638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  58.51 
 
 
796 aa  752    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  57.94 
 
 
810 aa  730    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  89.76 
 
 
815 aa  1359    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  69.17 
 
 
814 aa  961    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  44.22 
 
 
750 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  44.57 
 
 
775 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  43.6 
 
 
720 aa  469  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  46.11 
 
 
727 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  45.37 
 
 
728 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  46.24 
 
 
714 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  46.02 
 
 
727 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  45.86 
 
 
763 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  45 
 
 
741 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  45.3 
 
 
714 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  43.97 
 
 
734 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  45.85 
 
 
728 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  46.05 
 
 
720 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  44.59 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  47.11 
 
 
626 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  43.99 
 
 
734 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  43.85 
 
 
712 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  44.66 
 
 
739 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  44.37 
 
 
658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  44.16 
 
 
735 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  44.27 
 
 
757 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  43.41 
 
 
691 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  41.79 
 
 
779 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  41.8 
 
 
833 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  41.92 
 
 
776 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  39.93 
 
 
768 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  42.22 
 
 
770 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  44.98 
 
 
750 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  41.41 
 
 
723 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  44.1 
 
 
727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  41.71 
 
 
730 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  39.47 
 
 
759 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  45.23 
 
 
626 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  43.73 
 
 
656 aa  402  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  40.23 
 
 
669 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  41.71 
 
 
763 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  39.74 
 
 
712 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  43.04 
 
 
699 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  41.5 
 
 
732 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  41.08 
 
 
709 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  42.83 
 
 
654 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  42.54 
 
 
651 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40.5 
 
 
712 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  38.72 
 
 
788 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  39.32 
 
 
760 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  40.36 
 
 
757 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  38.47 
 
 
758 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  40.7 
 
 
744 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  39.42 
 
 
784 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  39.5 
 
 
759 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
831 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  40.22 
 
 
769 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  40.04 
 
 
750 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  39.11 
 
 
765 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  38.89 
 
 
742 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  38.65 
 
 
718 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  40.23 
 
 
764 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  39.67 
 
 
760 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  37.11 
 
 
724 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  36.68 
 
 
718 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  38.51 
 
 
788 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.71 
 
 
755 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  36.16 
 
 
707 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  37.46 
 
 
724 aa  363  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  38.6 
 
 
729 aa  363  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  42.06 
 
 
712 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  38.82 
 
 
714 aa  361  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.34 
 
 
776 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.6 
 
 
648 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  40.29 
 
 
743 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  39.3 
 
 
735 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  37.57 
 
 
811 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  40.22 
 
 
733 aa  347  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  40.08 
 
 
824 aa  346  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  39.89 
 
 
824 aa  344  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 
626 aa  343  5.999999999999999e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  37.84 
 
 
680 aa  342  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  37.21 
 
 
736 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.93 
 
 
727 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  36.33 
 
 
728 aa  340  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  39.5 
 
 
618 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 
692 aa  336  9e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.62 
 
 
661 aa  333  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 
776 aa  330  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  38.25 
 
 
658 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 
643 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 
643 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.15 
 
 
683 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.79 
 
 
655 aa  324  4e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.97 
 
 
761 aa  323  8e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 
795 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  38.4 
 
 
640 aa  319  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  41.29 
 
 
625 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.01 
 
 
727 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>