More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2820 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 727 aa  1502    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  49.2 
 
 		 828 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  54.66 
 
 		 727 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  50.63 
 
 		 765 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  50.08 
 
 		 761 aa  596  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  49.91 
 
 		 709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  42.14 
 
 		 905 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  40.61 
 
 		 795 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  41.46 
 
 		 806 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  41.4 
 
 		 880 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  37.58 
 
 		 941 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  38.53 
 
 		 706 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  38.63 
 
 		 705 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 		 814 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  38.99 
 
 		 843 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  39.64 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 746 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  38.13 
 
 		 705 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  37.96 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  37.79 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  40.75 
 
 		 776 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  38.13 
 
 		 705 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  38.65 
 
 		 761 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.4 
 
 		 661 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  37.79 
 
 		 705 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  38.5 
 
 		 746 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  39.89 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 		 912 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  39.89 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  39.72 
 
 		 680 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  39.89 
 
 		 667 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  35.09 
 
 		 794 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  40.25 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 679 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  39.89 
 
 		 680 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  37.52 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  37.54 
 
 		 679 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  39.72 
 
 		 673 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  38.49 
 
 		 640 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  39.72 
 
 		 673 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  37.63 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.97 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  38.06 
 
 		 640 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.27 
 
 		 643 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  39.52 
 
 		 770 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.27 
 
 		 643 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 		 901 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.42 
 
 		 648 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  37.25 
 
 		 705 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  36.59 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.05 
 
 		 712 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.6 
 
 		 755 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 824 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  39.01 
 
 		 763 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  38.18 
 
 		 775 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  39.17 
 
 		 730 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  37.33 
 
 		 658 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  36.39 
 
 		 707 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  38.49 
 
 		 832 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  40.11 
 
 		 646 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  39.19 
 
 		 836 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  38.49 
 
 		 830 aa  363  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  39.5 
 
 		 834 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  37.94 
 
 		 709 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  37.94 
 
 		 709 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  37.94 
 
 		 709 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  39.39 
 
 		 834 aa  361  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  39.33 
 
 		 835 aa  361  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 		 914 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  39.19 
 
 		 846 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  39.19 
 
 		 820 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.21 
 
 		 656 aa  360  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 720 aa  359  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  40.07 
 
 		 727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.17 
 
 		 728 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 		 728 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  37.54 
 
 		 714 aa  357  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 667 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  38.79 
 
 		 837 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  38.45 
 
 		 839 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  38.72 
 
 		 837 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.95 
 
 		 701 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.26 
 
 		 654 aa  355  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 704 aa  354  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  37.59 
 
 		 714 aa  354  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.76 
 
 		 648 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  40.2 
 
 		 714 aa  352  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  37.6 
 
 		 647 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  36.73 
 
 		 723 aa  351  3e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  39.53 
 
 		 751 aa  351  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.59 
 
 		 676 aa  351  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.29 
 
 		 649 aa  351  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.94 
 
 		 714 aa  351  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.67 
 
 		 744 aa  350  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  37.23 
 
 		 705 aa  350  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.45 
 
 		 692 aa  349  8e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  36.97 
 
 		 680 aa  349  9e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>