More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2100 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 661 aa  1362    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  55.48 
 
 		 648 aa  717    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  45.61 
 
 		 649 aa  551  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  40.71 
 
 		 668 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.84 
 
 		 704 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  39.08 
 
 		 667 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  38.76 
 
 		 662 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  39.35 
 
 		 806 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  37.2 
 
 		 705 aa  429  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.2 
 
 		 618 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  41.51 
 
 		 681 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  38.41 
 
 		 701 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  37.65 
 
 		 693 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  38.29 
 
 		 683 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  39.18 
 
 		 683 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.04 
 
 		 646 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  39.5 
 
 		 683 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  39.18 
 
 		 683 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  39.18 
 
 		 683 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  41.51 
 
 		 751 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  39.46 
 
 		 683 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  39.03 
 
 		 683 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  39.17 
 
 		 683 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  39.17 
 
 		 683 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  39.3 
 
 		 683 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  39.97 
 
 		 643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.63 
 
 		 744 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.05 
 
 		 643 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  42.17 
 
 		 761 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  39.97 
 
 		 643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  39.33 
 
 		 683 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  38.52 
 
 		 683 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.49 
 
 		 765 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.28 
 
 		 656 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  42.16 
 
 		 776 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  39.77 
 
 		 677 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  42.68 
 
 		 761 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 654 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  39.54 
 
 		 640 aa  392  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  38.82 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  41.33 
 
 		 727 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 		 727 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  39.36 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  39.3 
 
 		 676 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  40.69 
 
 		 824 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  42.4 
 
 		 709 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  41.23 
 
 		 712 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  41.93 
 
 		 811 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  40.52 
 
 		 824 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  40.94 
 
 		 755 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  37.06 
 
 		 665 aa  381  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  40.03 
 
 		 625 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  39.51 
 
 		 905 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.75 
 
 		 735 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  41.55 
 
 		 741 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  37.64 
 
 		 763 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  37.8 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.78 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 770 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  38.08 
 
 		 720 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  41.18 
 
 		 723 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  40.11 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.96 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.68 
 
 		 732 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  40.04 
 
 		 714 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  36.62 
 
 		 757 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 861 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  37.92 
 
 		 734 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  40.22 
 
 		 728 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  39.02 
 
 		 728 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  39.13 
 
 		 727 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  36.94 
 
 		 860 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.94 
 
 		 727 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  37.79 
 
 		 710 aa  364  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  40.04 
 
 		 712 aa  365  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  41.01 
 
 		 775 aa  365  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 828 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  37.5 
 
 		 739 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  39.46 
 
 		 779 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 		 720 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  39.46 
 
 		 776 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  36.99 
 
 		 855 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  34.3 
 
 		 774 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  35.87 
 
 		 853 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 		 760 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  37.35 
 
 		 642 aa  356  7.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.92 
 
 		 626 aa  356  7.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  36.66 
 
 		 829 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  38.14 
 
 		 679 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.84 
 
 		 762 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  39.42 
 
 		 833 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  36.88 
 
 		 642 aa  349  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  38.39 
 
 		 757 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 766 aa  347  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  38.49 
 
 		 654 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  35.78 
 
 		 655 aa  345  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  34.79 
 
 		 713 aa  344  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  34.67 
 
 		 824 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  35.88 
 
 		 687 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  34.05 
 
 		 755 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>