More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0389 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  64.38 
 
 
662 aa  858    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  59.26 
 
 
744 aa  785    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  59.82 
 
 
701 aa  791    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  61.84 
 
 
693 aa  858    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  64.82 
 
 
667 aa  883    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
656 aa  1347    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  63.88 
 
 
704 aa  855    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.62 
 
 
648 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 
661 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  38.33 
 
 
649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 
668 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.73 
 
 
646 aa  399  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  37.34 
 
 
905 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  39.39 
 
 
683 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 
681 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  36.89 
 
 
806 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  39.06 
 
 
761 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  39.66 
 
 
683 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  39.33 
 
 
683 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  39.5 
 
 
683 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  39.33 
 
 
683 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  39.33 
 
 
683 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  39.33 
 
 
683 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  39.33 
 
 
683 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  39.33 
 
 
683 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  39 
 
 
683 aa  379  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 
707 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  38.82 
 
 
683 aa  379  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  37.77 
 
 
709 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  37.4 
 
 
709 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  37.77 
 
 
709 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  38.13 
 
 
757 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.84 
 
 
751 aa  375  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 
713 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 
713 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 
713 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 
713 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 
713 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 
713 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.52 
 
 
727 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  39.52 
 
 
860 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.71 
 
 
765 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  37.18 
 
 
714 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 
705 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  42.13 
 
 
734 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.32 
 
 
712 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  37.14 
 
 
683 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  37.05 
 
 
714 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  37.7 
 
 
710 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 
676 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 
705 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.14 
 
 
727 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 
828 aa  359  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.68 
 
 
643 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.68 
 
 
643 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  38 
 
 
679 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 
618 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  40.37 
 
 
739 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 
853 aa  356  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 
648 aa  356  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  40.45 
 
 
720 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.96 
 
 
735 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  35.89 
 
 
770 aa  352  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  32.96 
 
 
642 aa  350  4e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.8 
 
 
665 aa  350  6e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  38.28 
 
 
855 aa  349  8e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  34.54 
 
 
642 aa  349  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  39.34 
 
 
861 aa  347  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.37 
 
 
776 aa  346  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 
723 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.97 
 
 
814 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 
643 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  36.61 
 
 
687 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 
730 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 
763 aa  342  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.82 
 
 
641 aa  342  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  40.15 
 
 
732 aa  340  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 
766 aa  340  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  36.78 
 
 
829 aa  339  9e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  35.3 
 
 
890 aa  339  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 
640 aa  339  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  35.25 
 
 
655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  40.65 
 
 
691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  38.69 
 
 
712 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.7 
 
 
734 aa  336  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  32.3 
 
 
760 aa  336  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  39.26 
 
 
827 aa  335  2e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  39.89 
 
 
779 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  39.81 
 
 
750 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.58 
 
 
710 aa  333  4e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  39.26 
 
 
827 aa  334  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  39.7 
 
 
757 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  39.7 
 
 
776 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  37.56 
 
 
833 aa  331  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.54 
 
 
625 aa  331  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  37.79 
 
 
677 aa  331  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.68 
 
 
727 aa  330  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.68 
 
 
727 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  39.11 
 
 
952 aa  330  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 
654 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>