More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2605 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  75.29 
 
 		 860 aa  1253    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 853 aa  1702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  44.42 
 
 		 855 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  45.61 
 
 		 861 aa  572  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  45.44 
 
 		 952 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  45.11 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  42.07 
 
 		 980 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  39.78 
 
 		 927 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  40.86 
 
 		 908 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 		 1037 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 		 761 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  37.63 
 
 		 762 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  29.53 
 
 		 857 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  39.14 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  39.63 
 
 		 798 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  36.64 
 
 		 719 aa  384  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.2 
 
 		 648 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  35.23 
 
 		 828 aa  376  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.87 
 
 		 661 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.75 
 
 		 765 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  39.74 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.82 
 
 		 751 aa  365  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.95 
 
 		 667 aa  360  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  32.46 
 
 		 770 aa  360  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  38.55 
 
 		 662 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.52 
 
 		 727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  40.62 
 
 		 625 aa  358  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.41 
 
 		 649 aa  357  5.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.96 
 
 		 656 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.68 
 
 		 701 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.81 
 
 		 693 aa  355  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  35.11 
 
 		 905 aa  355  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 		 744 aa  352  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.25 
 
 		 681 aa  351  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  41.77 
 
 		 712 aa  350  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 704 aa  349  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 		 774 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  35.76 
 
 		 683 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.99 
 
 		 648 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.02 
 
 		 806 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.76 
 
 		 640 aa  348  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 		 654 aa  348  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.61 
 
 		 683 aa  347  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.77 
 
 		 683 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 683 aa  346  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 683 aa  346  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  37.1 
 
 		 683 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  36.94 
 
 		 683 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 683 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.61 
 
 		 683 aa  344  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 683 aa  343  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.26 
 
 		 643 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.32 
 
 		 643 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  40.39 
 
 		 714 aa  342  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.32 
 
 		 643 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  39.62 
 
 		 691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  41.05 
 
 		 677 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 		 795 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  40.93 
 
 		 728 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.3 
 
 		 683 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  39.93 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 683 aa  333  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.83 
 
 		 646 aa  333  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 829 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  39.44 
 
 		 727 aa  333  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  40.8 
 
 		 727 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  39.48 
 
 		 779 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  38.71 
 
 		 775 aa  330  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  37.64 
 
 		 728 aa  330  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 		 712 aa  328  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  38.52 
 
 		 741 aa  328  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  41.26 
 
 		 709 aa  325  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  38.07 
 
 		 734 aa  324  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  39.53 
 
 		 782 aa  324  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  38.61 
 
 		 779 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  39.81 
 
 		 782 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  38.61 
 
 		 776 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.93 
 
 		 708 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.26 
 
 		 640 aa  322  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.19 
 
 		 776 aa  322  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  36.05 
 
 		 768 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  37.58 
 
 		 757 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  38.2 
 
 		 750 aa  319  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  35.3 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  34.75 
 
 		 655 aa  319  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 		 727 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.28 
 
 		 757 aa  318  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.31 
 
 		 739 aa  317  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  43.6 
 
 		 796 aa  316  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  36.74 
 
 		 732 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 		 720 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  35.59 
 
 		 680 aa  315  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  36.55 
 
 		 734 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  34.85 
 
 		 880 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.09 
 
 		 833 aa  313  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.07 
 
 		 770 aa  313  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  42.88 
 
 		 810 aa  311  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  35.76 
 
 		 714 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  38.95 
 
 		 723 aa  310  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.71 
 
 		 720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>