More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1927 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
782 aa  1467    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  92.57 
 
 
779 aa  1290    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  96.04 
 
 
782 aa  1300    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  39.14 
 
 
719 aa  453  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  40.65 
 
 
798 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  37.62 
 
 
762 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.16 
 
 
774 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  36.18 
 
 
860 aa  360  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 
759 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  39.16 
 
 
853 aa  342  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  29.27 
 
 
857 aa  337  7e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  35.52 
 
 
801 aa  331  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  34.44 
 
 
770 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  34.16 
 
 
952 aa  314  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  36.26 
 
 
855 aa  313  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  41.4 
 
 
771 aa  307  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  41.4 
 
 
771 aa  306  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  41.22 
 
 
771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  41.22 
 
 
771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  41.22 
 
 
771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  38.24 
 
 
770 aa  304  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  38.07 
 
 
770 aa  302  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  38.07 
 
 
770 aa  302  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  38.07 
 
 
770 aa  302  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  38.07 
 
 
770 aa  302  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  38.07 
 
 
770 aa  302  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  37.9 
 
 
770 aa  300  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  38.24 
 
 
770 aa  300  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  39.21 
 
 
774 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  38.07 
 
 
770 aa  299  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  37.12 
 
 
861 aa  298  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  37.85 
 
 
680 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  35.7 
 
 
774 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  37.13 
 
 
793 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  40.62 
 
 
794 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  40.62 
 
 
794 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 
927 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  41.81 
 
 
696 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
908 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  33.72 
 
 
766 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  37.71 
 
 
706 aa  278  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  38.31 
 
 
706 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  38.72 
 
 
729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  34.35 
 
 
816 aa  273  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  41.87 
 
 
747 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  36.68 
 
 
745 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  34.95 
 
 
780 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  38.55 
 
 
784 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  36.65 
 
 
784 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  38.72 
 
 
784 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  38.5 
 
 
750 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  38.34 
 
 
793 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  38.66 
 
 
742 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  38.18 
 
 
696 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  29.52 
 
 
774 aa  267  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  37.52 
 
 
713 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  40.64 
 
 
745 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  38.56 
 
 
844 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  41.31 
 
 
747 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  41.31 
 
 
747 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  41.31 
 
 
747 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  36.09 
 
 
745 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  34.56 
 
 
782 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  37.52 
 
 
745 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  39.06 
 
 
705 aa  266  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  37.9 
 
 
784 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  36.72 
 
 
731 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  32.76 
 
 
762 aa  265  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  33.77 
 
 
980 aa  264  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  38.19 
 
 
780 aa  264  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.35 
 
 
728 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  39.18 
 
 
774 aa  263  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 
770 aa  261  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.96 
 
 
648 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  37.16 
 
 
695 aa  260  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  38 
 
 
782 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  31.31 
 
 
772 aa  258  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  35.95 
 
 
785 aa  257  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  36.56 
 
 
747 aa  257  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  35.11 
 
 
807 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0242  glycosyl transferase family 51  34.83 
 
 
810 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.378731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  35.18 
 
 
728 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  39.07 
 
 
774 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  40.6 
 
 
726 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.19 
 
 
727 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  36.87 
 
 
799 aa  254  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.48 
 
 
727 aa  253  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  31.31 
 
 
775 aa  253  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 
763 aa  253  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  35.38 
 
 
730 aa  253  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 
741 aa  253  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  33.87 
 
 
778 aa  252  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  36.5 
 
 
1060 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 
714 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  37.14 
 
 
684 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1293  penicillin-binding protein 1C  34.29 
 
 
772 aa  250  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  34.58 
 
 
759 aa  249  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.98 
 
 
661 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  33.45 
 
 
779 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.98 
 
 
649 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>