More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2389 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  52.5 
 
 		 727 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  51.52 
 
 		 765 aa  733    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 727 aa  1494    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  50.72 
 
 		 761 aa  682    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  50.07 
 
 		 828 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  43.72 
 
 		 905 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  47.52 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  41.12 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  37.15 
 
 		 795 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.71 
 
 		 814 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  35.7 
 
 		 941 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  40.46 
 
 		 880 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  40.1 
 
 		 706 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  38.97 
 
 		 829 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  40.1 
 
 		 648 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  41.01 
 
 		 712 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.72 
 
 		 661 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 680 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  35.01 
 
 		 824 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 		 843 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  35.12 
 
 		 693 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.92 
 
 		 705 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  37.46 
 
 		 679 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  36.62 
 
 		 704 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.24 
 
 		 640 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  38.17 
 
 		 618 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  37.23 
 
 		 662 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  38.31 
 
 		 680 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.34 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  37.24 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  38.19 
 
 		 680 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  38.37 
 
 		 680 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 		 643 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 680 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  38.01 
 
 		 673 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  38.01 
 
 		 680 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  38.24 
 
 		 834 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 		 776 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  37.73 
 
 		 830 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  36.75 
 
 		 642 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  38.01 
 
 		 673 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 648 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  37.56 
 
 		 832 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  38.25 
 
 		 746 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 		 643 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 		 835 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.98 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 836 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 640 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 679 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  37.2 
 
 		 705 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  37.2 
 
 		 705 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  37.8 
 
 		 834 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  37.04 
 
 		 705 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  37.04 
 
 		 705 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  37.04 
 
 		 705 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 		 912 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  37.73 
 
 		 642 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  37.2 
 
 		 705 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  37.73 
 
 		 820 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 		 794 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  37.67 
 
 		 837 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  37.39 
 
 		 837 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  37.73 
 
 		 846 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 667 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  37.13 
 
 		 746 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.41 
 
 		 761 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 914 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 839 aa  362  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.01 
 
 		 744 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  35.63 
 
 		 901 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.85 
 
 		 705 aa  361  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.56 
 
 		 701 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  36.21 
 
 		 658 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  35.89 
 
 		 897 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  35.73 
 
 		 897 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  35.89 
 
 		 896 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  35.89 
 
 		 897 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  35.89 
 
 		 897 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  35.83 
 
 		 905 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.23 
 
 		 625 aa  357  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  35.73 
 
 		 900 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  34.68 
 
 		 708 aa  357  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  36.32 
 
 		 656 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  35.66 
 
 		 705 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  35.41 
 
 		 865 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.46 
 
 		 692 aa  354  4e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.54 
 
 		 655 aa  353  5e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 691 aa  353  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  35.41 
 
 		 897 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.41 
 
 		 811 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  37.42 
 
 		 732 aa  353  7e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.93 
 
 		 654 aa  353  8e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.22 
 
 		 755 aa  352  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  35.23 
 
 		 817 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  36.76 
 
 		 727 aa  350  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 		 853 aa  350  7e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  36.3 
 
 		 647 aa  350  8e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.15 
 
 		 775 aa  349  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>