More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0950 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  69.55 
 
 
755 aa  1049    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  57.51 
 
 
824 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
776 aa  1585    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  57.7 
 
 
824 aa  738    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  55.59 
 
 
712 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  55.8 
 
 
626 aa  706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  53.99 
 
 
811 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  48.35 
 
 
658 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  45.7 
 
 
680 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  45.47 
 
 
602 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  46.71 
 
 
692 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  43.26 
 
 
732 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  42.69 
 
 
734 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  42.21 
 
 
734 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  41.94 
 
 
739 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  41.94 
 
 
775 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  40.72 
 
 
735 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  42.42 
 
 
643 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  41.67 
 
 
714 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  42.4 
 
 
643 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  41.25 
 
 
720 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  42.4 
 
 
643 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  40.92 
 
 
714 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  42.11 
 
 
757 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  40.78 
 
 
741 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.36 
 
 
751 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  42.93 
 
 
640 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  43.59 
 
 
750 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  42.1 
 
 
618 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  38.97 
 
 
720 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  41.92 
 
 
640 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  40.77 
 
 
770 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.17 
 
 
751 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.17 
 
 
751 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  43.14 
 
 
762 aa  409  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 
727 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  40.03 
 
 
727 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  41.24 
 
 
651 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  39.42 
 
 
723 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  39.86 
 
 
728 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  38.77 
 
 
779 aa  406  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  39.3 
 
 
806 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  38.27 
 
 
776 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  40.37 
 
 
691 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  42.16 
 
 
661 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.04 
 
 
728 aa  399  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 
648 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  40.18 
 
 
646 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  40.5 
 
 
763 aa  395  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  40.5 
 
 
730 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  40.03 
 
 
654 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  39.49 
 
 
750 aa  396  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  40.75 
 
 
727 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  38.64 
 
 
742 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 
718 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  39.63 
 
 
751 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40.87 
 
 
761 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  39.86 
 
 
712 aa  386  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.69 
 
 
833 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.96 
 
 
761 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  38.35 
 
 
712 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  39.61 
 
 
768 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  38.84 
 
 
625 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  40.81 
 
 
763 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  37.85 
 
 
732 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 
714 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 
669 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 
760 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  38.6 
 
 
759 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  36.66 
 
 
764 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  38.46 
 
 
759 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  37.81 
 
 
756 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.21 
 
 
765 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  40.85 
 
 
740 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  38.64 
 
 
712 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  40.83 
 
 
658 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  38.89 
 
 
760 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  41.65 
 
 
709 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 
784 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.94 
 
 
668 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.33 
 
 
757 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  38.24 
 
 
765 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  39.14 
 
 
656 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  39.76 
 
 
796 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.22 
 
 
727 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.96 
 
 
649 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  37.27 
 
 
709 aa  365  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  38.63 
 
 
710 aa  362  1e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  39.34 
 
 
693 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  37.72 
 
 
589 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  40.44 
 
 
626 aa  362  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  37.43 
 
 
757 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  37.43 
 
 
769 aa  360  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 
724 aa  360  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 
828 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 
718 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 
724 aa  357  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  36.69 
 
 
744 aa  356  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  37.57 
 
 
750 aa  356  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  38.72 
 
 
810 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>