More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0864 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  69.79 
 
 
743 aa  1051    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  51.9 
 
 
718 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  49.57 
 
 
724 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  50.84 
 
 
736 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
760 aa  1560    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  55.06 
 
 
758 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  95.82 
 
 
765 aa  1456    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  53.46 
 
 
759 aa  765    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  70.12 
 
 
744 aa  1087    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  56.62 
 
 
742 aa  832    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  51.75 
 
 
724 aa  686    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  56.86 
 
 
718 aa  838    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  51.06 
 
 
707 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  95.82 
 
 
784 aa  1456    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  52.83 
 
 
759 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  53.83 
 
 
769 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  50.92 
 
 
733 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  53.95 
 
 
757 aa  779    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  55.49 
 
 
768 aa  739    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  54.23 
 
 
750 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  53.31 
 
 
760 aa  770    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  76.41 
 
 
764 aa  1170    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  50.5 
 
 
714 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  51.3 
 
 
728 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  42.49 
 
 
728 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  43.62 
 
 
714 aa  475  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  41.9 
 
 
734 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  43.1 
 
 
714 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  41.75 
 
 
727 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  41.75 
 
 
727 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  42.83 
 
 
728 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  42.71 
 
 
734 aa  458  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  41.73 
 
 
691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  43.36 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  42.23 
 
 
712 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  41.16 
 
 
735 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  41.51 
 
 
739 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  41.62 
 
 
720 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  41.51 
 
 
720 aa  449  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  40.34 
 
 
776 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  41.32 
 
 
741 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  43.21 
 
 
757 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  40.27 
 
 
779 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  42.11 
 
 
775 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  41.98 
 
 
651 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  39.83 
 
 
770 aa  419  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.55 
 
 
833 aa  419  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  41.05 
 
 
654 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  40.55 
 
 
656 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  40.25 
 
 
750 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  39.82 
 
 
730 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  40.61 
 
 
723 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  39.65 
 
 
763 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  39.8 
 
 
669 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  40.11 
 
 
712 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  39.78 
 
 
796 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.66 
 
 
712 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  39.41 
 
 
810 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.2 
 
 
776 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  39.69 
 
 
815 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  40.3 
 
 
732 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  39.44 
 
 
830 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 
831 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  39.44 
 
 
830 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 
788 aa  364  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  36.45 
 
 
763 aa  360  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  37.08 
 
 
788 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  36.42 
 
 
735 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  36.17 
 
 
824 aa  357  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  36.84 
 
 
712 aa  356  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 
626 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 
824 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  38.6 
 
 
658 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.95 
 
 
751 aa  353  8e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 
727 aa  353  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.61 
 
 
811 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  37.45 
 
 
626 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  39.18 
 
 
750 aa  351  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  40.1 
 
 
699 aa  348  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  38.45 
 
 
814 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  34.92 
 
 
729 aa  343  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.08 
 
 
626 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.19 
 
 
755 aa  339  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 
776 aa  339  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.66 
 
 
654 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  36.69 
 
 
709 aa  336  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  36.3 
 
 
658 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.7 
 
 
618 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.36 
 
 
625 aa  326  9e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  35.48 
 
 
680 aa  326  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 
744 aa  326  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.49 
 
 
648 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  35.63 
 
 
692 aa  318  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.07 
 
 
640 aa  316  9e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.66 
 
 
643 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.08 
 
 
751 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.8 
 
 
646 aa  313  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 
765 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 
795 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  35.65 
 
 
602 aa  311  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>