More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0805 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  60.47 
 
 
602 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  82.3 
 
 
692 aa  1006    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
680 aa  1390    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  69.83 
 
 
658 aa  933    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  53.37 
 
 
712 aa  595  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  46.52 
 
 
776 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  46.41 
 
 
755 aa  539  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  47.22 
 
 
626 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  45.41 
 
 
811 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  44.46 
 
 
824 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  44.31 
 
 
824 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  39.56 
 
 
589 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  39.22 
 
 
589 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  39.19 
 
 
589 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  39.14 
 
 
589 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.2 
 
 
775 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.11 
 
 
734 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  39.93 
 
 
739 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.24 
 
 
735 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  39.41 
 
 
720 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.23 
 
 
751 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  40.18 
 
 
768 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  39.08 
 
 
723 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 
770 aa  364  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  37.21 
 
 
779 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  37.37 
 
 
776 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37 
 
 
618 aa  360  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  36.54 
 
 
806 aa  359  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.61 
 
 
732 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.19 
 
 
643 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.88 
 
 
643 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.88 
 
 
643 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.87 
 
 
720 aa  353  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.04 
 
 
734 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
730 aa  352  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
763 aa  352  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  36.38 
 
 
741 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 
718 aa  352  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.73 
 
 
761 aa  349  9e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 
750 aa  349  9e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.39 
 
 
648 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.97 
 
 
727 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  38.27 
 
 
732 aa  349  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.02 
 
 
625 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  37.72 
 
 
759 aa  346  7e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  36.62 
 
 
714 aa  346  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  39.51 
 
 
757 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 
728 aa  345  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  37.46 
 
 
727 aa  345  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  37.28 
 
 
651 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  36.23 
 
 
728 aa  343  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  35.03 
 
 
724 aa  343  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  36.83 
 
 
833 aa  343  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 
640 aa  343  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 
712 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  35.03 
 
 
718 aa  343  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  35.36 
 
 
759 aa  343  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  34.75 
 
 
724 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 
727 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.17 
 
 
691 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  36.5 
 
 
714 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  38.14 
 
 
742 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.42 
 
 
727 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.76 
 
 
640 aa  340  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.68 
 
 
714 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  35.28 
 
 
757 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.57 
 
 
648 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  38.7 
 
 
750 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 
646 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.6 
 
 
649 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  35.35 
 
 
769 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  38.54 
 
 
709 aa  336  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  38.3 
 
 
712 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  39.09 
 
 
751 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  35.91 
 
 
744 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  36.67 
 
 
760 aa  335  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  38.71 
 
 
751 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  35.59 
 
 
750 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  36.84 
 
 
654 aa  333  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.15 
 
 
693 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  38.21 
 
 
658 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  35.57 
 
 
662 aa  330  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  38.01 
 
 
761 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 
654 aa  329  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  34.51 
 
 
667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 
661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.84 
 
 
751 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.7 
 
 
709 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.05 
 
 
765 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  34.33 
 
 
758 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  37.41 
 
 
740 aa  327  5e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  35.74 
 
 
707 aa  326  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  35.3 
 
 
784 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  35.3 
 
 
765 aa  326  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  37.46 
 
 
656 aa  326  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  35.48 
 
 
760 aa  326  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 
669 aa  325  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 
830 aa  324  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  34.53 
 
 
712 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 
681 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>