More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04891 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  100 
 
 
589 aa  1163    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  69.27 
 
 
589 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  68.76 
 
 
589 aa  803    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  68.59 
 
 
589 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  43.47 
 
 
602 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  40.33 
 
 
658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  39.22 
 
 
680 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.41 
 
 
692 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.72 
 
 
776 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.67 
 
 
712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.96 
 
 
755 aa  352  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.62 
 
 
626 aa  336  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.56 
 
 
811 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.06 
 
 
824 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.06 
 
 
824 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.78 
 
 
761 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.02 
 
 
727 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 
712 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  32.57 
 
 
768 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  31.8 
 
 
775 aa  289  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  32.04 
 
 
709 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  31.56 
 
 
732 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.24 
 
 
734 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.22 
 
 
734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  30.19 
 
 
759 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.86 
 
 
727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  32.04 
 
 
727 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.44 
 
 
806 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  30.31 
 
 
714 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.71 
 
 
720 aa  282  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.61 
 
 
728 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  31.79 
 
 
796 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  31.84 
 
 
750 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  32.35 
 
 
744 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  29.8 
 
 
646 aa  280  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  29.83 
 
 
760 aa  280  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.58 
 
 
739 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  30.18 
 
 
759 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  30.37 
 
 
714 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  30.42 
 
 
765 aa  276  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  30.42 
 
 
784 aa  276  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  30.6 
 
 
760 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  29.4 
 
 
769 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  29.94 
 
 
732 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  28.4 
 
 
691 aa  273  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.35 
 
 
735 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  30.31 
 
 
728 aa  273  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 
626 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  31.98 
 
 
810 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.66 
 
 
770 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.42 
 
 
757 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  28.76 
 
 
750 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  29.87 
 
 
757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  28.9 
 
 
718 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  28.9 
 
 
724 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  32.57 
 
 
763 aa  270  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  31.45 
 
 
742 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  28.46 
 
 
741 aa  269  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.31 
 
 
640 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  29.42 
 
 
714 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  28.94 
 
 
654 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  30.67 
 
 
718 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  32.28 
 
 
665 aa  268  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  30.93 
 
 
720 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.17 
 
 
712 aa  267  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  31.44 
 
 
727 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.97 
 
 
648 aa  266  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  28.91 
 
 
758 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  30.99 
 
 
707 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  30.2 
 
 
751 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  29.09 
 
 
724 aa  264  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.36 
 
 
723 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  30.33 
 
 
751 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  29.3 
 
 
709 aa  263  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 
779 aa  263  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  33.86 
 
 
763 aa  262  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.89 
 
 
643 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  32.16 
 
 
658 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  33.66 
 
 
730 aa  262  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  31.01 
 
 
712 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  28.45 
 
 
651 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  32.34 
 
 
699 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 
776 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  30.16 
 
 
751 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  32.03 
 
 
833 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  29.02 
 
 
669 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.21 
 
 
649 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  29.2 
 
 
618 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 
740 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  29.81 
 
 
640 aa  257  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
831 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  29.1 
 
 
643 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  29.1 
 
 
643 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  31.24 
 
 
743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  30.93 
 
 
656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  27.62 
 
 
788 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  27.99 
 
 
765 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  30.33 
 
 
751 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  30.47 
 
 
764 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.46 
 
 
710 aa  253  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>