More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1056 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
751 aa  1536    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  42.9 
 
 
640 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  42.9 
 
 
640 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  43.67 
 
 
654 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  41.78 
 
 
618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  40.33 
 
 
648 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  41.05 
 
 
643 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  40.87 
 
 
643 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  40.87 
 
 
643 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.13 
 
 
661 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  41.09 
 
 
648 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  42.26 
 
 
625 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  40.23 
 
 
646 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  36.85 
 
 
642 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  40.03 
 
 
714 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  38.11 
 
 
676 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  39.59 
 
 
714 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.38 
 
 
728 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.33 
 
 
776 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.28 
 
 
655 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  37.99 
 
 
642 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  38.91 
 
 
728 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  38.16 
 
 
662 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.8 
 
 
727 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.8 
 
 
727 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  40.38 
 
 
775 aa  389  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.77 
 
 
734 aa  389  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.39 
 
 
765 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  40.82 
 
 
732 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  38.71 
 
 
649 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.87 
 
 
667 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  35.78 
 
 
693 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  39.87 
 
 
718 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 
668 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 
739 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 
755 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  41.03 
 
 
712 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  41.71 
 
 
709 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 
905 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  36.6 
 
 
795 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.61 
 
 
641 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  35.89 
 
 
704 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  38.54 
 
 
679 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  37.73 
 
 
806 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  36.43 
 
 
707 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  39.83 
 
 
687 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  35.33 
 
 
638 aa  368  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 
714 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.14 
 
 
656 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.97 
 
 
811 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  38.69 
 
 
680 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.59 
 
 
735 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  39.58 
 
 
757 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  37.99 
 
 
759 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  39.01 
 
 
720 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  38.08 
 
 
734 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 
709 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.34 
 
 
665 aa  365  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  38.17 
 
 
713 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  38.17 
 
 
713 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  38.17 
 
 
713 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  38.25 
 
 
713 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  38.25 
 
 
713 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  38.25 
 
 
713 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  37.56 
 
 
709 aa  364  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  37.56 
 
 
709 aa  364  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  39.27 
 
 
769 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.89 
 
 
712 aa  363  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  39.2 
 
 
779 aa  363  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  37.73 
 
 
720 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  37.4 
 
 
714 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  39.14 
 
 
654 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  38.41 
 
 
757 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  39.3 
 
 
691 aa  360  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 
710 aa  359  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  37.14 
 
 
824 aa  360  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  38.3 
 
 
758 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  37.4 
 
 
705 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  37.89 
 
 
757 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  39.58 
 
 
776 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  37.72 
 
 
742 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  39.54 
 
 
761 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  36.97 
 
 
824 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.88 
 
 
626 aa  357  5e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  38.64 
 
 
750 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  39.58 
 
 
744 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  37.77 
 
 
860 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  37.95 
 
 
759 aa  355  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  40.96 
 
 
750 aa  355  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  34.83 
 
 
644 aa  355  2e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.73 
 
 
762 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  38.43 
 
 
760 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.03 
 
 
744 aa  354  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  38.58 
 
 
760 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 
669 aa  353  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 
764 aa  353  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.84 
 
 
727 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.88 
 
 
770 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  38.54 
 
 
723 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  37.85 
 
 
741 aa  352  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>