More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0832 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  79.14 
 
 		 709 aa  1053    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  79.2 
 
 		 709 aa  1057    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  77.88 
 
 		 714 aa  1016    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  78.84 
 
 		 705 aa  1051    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  78.67 
 
 		 714 aa  1048    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 713 aa  1423    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  99.72 
 
 		 713 aa  1418    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  99.72 
 
 		 713 aa  1418    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  77.34 
 
 		 707 aa  1083    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  90.76 
 
 		 710 aa  1254    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 713 aa  1423    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 713 aa  1423    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  79.14 
 
 		 709 aa  1053    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  99.72 
 
 		 713 aa  1418    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  50.81 
 
 		 679 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  49.51 
 
 		 687 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.73 
 
 		 646 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 		 667 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  38.96 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  38.99 
 
 		 693 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.66 
 
 		 656 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  36.51 
 
 		 641 aa  372  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  49.6 
 
 		 773 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 		 751 aa  364  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.32 
 
 		 645 aa  363  8e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.43 
 
 		 712 aa  359  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 		 806 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 		 704 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  34.06 
 
 		 642 aa  358  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  35.11 
 
 		 642 aa  355  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.04 
 
 		 654 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  36.91 
 
 		 744 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.25 
 
 		 776 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.28 
 
 		 655 aa  348  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 750 aa  347  6e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 		 701 aa  347  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 760 aa  346  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.12 
 
 		 727 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 		 727 aa  345  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.44 
 
 		 727 aa  345  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  38.81 
 
 		 770 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  38.7 
 
 		 728 aa  344  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.27 
 
 		 720 aa  344  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.7 
 
 		 714 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  33.48 
 
 		 774 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  35.32 
 
 		 755 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  35.02 
 
 		 730 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.84 
 
 		 643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.84 
 
 		 643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.46 
 
 		 661 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.56 
 
 		 811 aa  337  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.02 
 
 		 752 aa  336  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.63 
 
 		 640 aa  336  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 		 648 aa  336  7.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.45 
 
 		 762 aa  335  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  36.55 
 
 		 710 aa  331  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  47.59 
 
 		 766 aa  332  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.04 
 
 		 643 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.8 
 
 		 618 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 		 643 aa  330  8e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 		 643 aa  330  8e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 		 643 aa  330  8e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  37.61 
 
 		 714 aa  330  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  35.09 
 
 		 658 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  38.23 
 
 		 730 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  34.52 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  37.36 
 
 		 732 aa  328  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 763 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.68 
 
 		 640 aa  326  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  34.58 
 
 		 727 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  38.67 
 
 		 827 aa  325  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  36.94 
 
 		 728 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  38.67 
 
 		 827 aa  324  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.45 
 
 		 638 aa  323  5e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  34.8 
 
 		 880 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 		 676 aa  323  8e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.95 
 
 		 683 aa  323  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 		 755 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.18 
 
 		 734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  37.95 
 
 		 723 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.84 
 
 		 648 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.16 
 
 		 625 aa  321  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  37.39 
 
 		 766 aa  321  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 683 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.33 
 
 		 649 aa  320  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 683 aa  320  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 683 aa  320  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  36.47 
 
 		 833 aa  320  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  45.97 
 
 		 801 aa  319  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.58 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  36.99 
 
 		 712 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  37.36 
 
 		 775 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.11 
 
 		 776 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.11 
 
 		 779 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 		 761 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  33.88 
 
 		 602 aa  317  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 626 aa  317  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 		 680 aa  316  9e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>