More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2152 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 773 aa  1573    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  46.61 
 
 		 794 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  46.61 
 
 		 779 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  44.93 
 
 		 766 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  43.36 
 
 		 801 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  42.93 
 
 		 797 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  43.56 
 
 		 778 aa  608  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  44.77 
 
 		 793 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  43.09 
 
 		 777 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  44.4 
 
 		 824 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  44.34 
 
 		 792 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  43.09 
 
 		 777 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  42.73 
 
 		 804 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  42.5 
 
 		 778 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  46.27 
 
 		 797 aa  598  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  42.75 
 
 		 795 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  43.04 
 
 		 791 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  44.3 
 
 		 799 aa  598  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  44.28 
 
 		 796 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  42.75 
 
 		 797 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  42.82 
 
 		 797 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  42.23 
 
 		 805 aa  594  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  44.04 
 
 		 799 aa  592  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  42.51 
 
 		 797 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  42.71 
 
 		 797 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  42.47 
 
 		 796 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  42.88 
 
 		 797 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  42.71 
 
 		 797 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  42.71 
 
 		 797 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  42.71 
 
 		 797 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  44.84 
 
 		 771 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  42.71 
 
 		 770 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  43.68 
 
 		 802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  42.71 
 
 		 797 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  42.58 
 
 		 797 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  42.58 
 
 		 797 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  45.06 
 
 		 777 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  42.88 
 
 		 799 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  44.61 
 
 		 840 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  43.1 
 
 		 797 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  43.78 
 
 		 840 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  43.78 
 
 		 846 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  43.78 
 
 		 840 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  43.78 
 
 		 840 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  42.8 
 
 		 786 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  43.64 
 
 		 852 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  42.82 
 
 		 791 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  42.71 
 
 		 839 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  42.23 
 
 		 833 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  42.37 
 
 		 839 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  43.91 
 
 		 840 aa  562  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  43.91 
 
 		 840 aa  562  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  44.31 
 
 		 774 aa  562  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  41.8 
 
 		 838 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  41.34 
 
 		 839 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  42.11 
 
 		 836 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  42.15 
 
 		 837 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  42.42 
 
 		 839 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0917  penicillin-binding protein 1A  42.31 
 
 		 752 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  42.42 
 
 		 839 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  43.71 
 
 		 778 aa  548  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  44.61 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 		 793 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  40.11 
 
 		 830 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  39.5 
 
 		 793 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  39.36 
 
 		 793 aa  499  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  39.7 
 
 		 814 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  37.64 
 
 		 794 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  37.5 
 
 		 794 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0176  1A family penicillin-binding protein  41.83 
 
 		 776 aa  489  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  36.96 
 
 		 804 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.71 
 
 		 817 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  37.6 
 
 		 846 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  39.66 
 
 		 800 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  36.62 
 
 		 814 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  39.97 
 
 		 803 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  40.54 
 
 		 790 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 		 790 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  38.56 
 
 		 817 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  37.66 
 
 		 819 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  37.12 
 
 		 814 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  38.17 
 
 		 817 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  37.11 
 
 		 823 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  38.28 
 
 		 817 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  37.38 
 
 		 814 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  38.28 
 
 		 817 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  36.72 
 
 		 823 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  37.23 
 
 		 839 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  36.94 
 
 		 815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  35.7 
 
 		 846 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 		 854 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  40.97 
 
 		 803 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  35.88 
 
 		 846 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  37.26 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 795 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  35.76 
 
 		 818 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  36.16 
 
 		 827 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  36.65 
 
 		 804 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  37.19 
 
 		 818 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  37.31 
 
 		 773 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>