More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1935 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  55.03 
 
 		 802 aa  827    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  62.31 
 
 		 777 aa  964    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  53.9 
 
 		 774 aa  819    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  88.9 
 
 		 840 aa  1495    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  93.56 
 
 		 837 aa  1572    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  62.82 
 
 		 801 aa  976    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  53.1 
 
 		 766 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  55.74 
 
 		 824 aa  869    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  88.9 
 
 		 846 aa  1513    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  65.69 
 
 		 797 aa  1033    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  88.9 
 
 		 840 aa  1513    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  57.36 
 
 		 771 aa  845    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  54.87 
 
 		 778 aa  805    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  55.91 
 
 		 805 aa  882    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  88.9 
 
 		 840 aa  1513    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  60.91 
 
 		 791 aa  964    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  65.69 
 
 		 797 aa  1032    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  54.3 
 
 		 793 aa  792    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  89.02 
 
 		 852 aa  1515    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  88.9 
 
 		 840 aa  1495    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  65.69 
 
 		 797 aa  1032    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  66.15 
 
 		 770 aa  1033    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  62.44 
 
 		 777 aa  965    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  65.74 
 
 		 796 aa  1067    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  94.28 
 
 		 838 aa  1579    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  55.69 
 
 		 793 aa  830    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  65.69 
 
 		 797 aa  1032    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  74.17 
 
 		 833 aa  1279    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  95.71 
 
 		 839 aa  1610    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  95.59 
 
 		 839 aa  1598    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  57.8 
 
 		 777 aa  842    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  66.67 
 
 		 797 aa  1084    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  57.87 
 
 		 799 aa  838    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  88.42 
 
 		 840 aa  1507    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  65.98 
 
 		 797 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  78.7 
 
 		 786 aa  1285    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  55.37 
 
 		 778 aa  829    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0917  penicillin-binding protein 1A  52.65 
 
 		 752 aa  789    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  53.38 
 
 		 797 aa  839    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0176  1A family penicillin-binding protein  49.72 
 
 		 776 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  56.55 
 
 		 791 aa  796    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  56.69 
 
 		 804 aa  880    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  66.41 
 
 		 799 aa  1062    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  74.53 
 
 		 836 aa  1285    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  65.01 
 
 		 795 aa  1058    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  99.52 
 
 		 839 aa  1702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  65.78 
 
 		 799 aa  1059    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  60.23 
 
 		 792 aa  955    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  88.9 
 
 		 840 aa  1513    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  54.73 
 
 		 794 aa  858    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  55.51 
 
 		 778 aa  838    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  66.28 
 
 		 797 aa  1073    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  65.69 
 
 		 797 aa  1033    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  55.32 
 
 		 807 aa  762    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  95.59 
 
 		 839 aa  1598    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  54.86 
 
 		 779 aa  860    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  54.37 
 
 		 797 aa  818    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  65.52 
 
 		 796 aa  1071    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  66.41 
 
 		 797 aa  1077    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  65.01 
 
 		 797 aa  1057    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 839 aa  1710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  65.69 
 
 		 797 aa  1033    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  66.41 
 
 		 797 aa  1077    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  45.39 
 
 		 814 aa  631  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  44.74 
 
 		 793 aa  605  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  44.01 
 
 		 794 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  43.88 
 
 		 794 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  44.61 
 
 		 793 aa  604  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.96 
 
 		 817 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  44.03 
 
 		 803 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  42.38 
 
 		 814 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  42.13 
 
 		 830 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  42.32 
 
 		 823 aa  592  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  43.07 
 
 		 804 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  40.58 
 
 		 819 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  41.81 
 
 		 823 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  42.04 
 
 		 815 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  41.05 
 
 		 814 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  40.8 
 
 		 817 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  41.61 
 
 		 814 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  41.36 
 
 		 846 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  43.58 
 
 		 800 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  39.88 
 
 		 817 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  39.88 
 
 		 817 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  40.27 
 
 		 817 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  41.61 
 
 		 773 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  44.22 
 
 		 803 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  40.18 
 
 		 839 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  42.65 
 
 		 790 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  39.92 
 
 		 839 aa  552  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  39.92 
 
 		 839 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  41.09 
 
 		 790 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  39.42 
 
 		 839 aa  545  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 844 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 844 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  39.47 
 
 		 846 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  39.45 
 
 		 844 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 		 822 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  39.92 
 
 		 807 aa  537  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  39.45 
 
 		 852 aa  539  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>