More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4121 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  49.06 
 
 
817 aa  780    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  48.81 
 
 
817 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  48.2 
 
 
823 aa  774    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  46 
 
 
846 aa  725    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  45.87 
 
 
830 aa  714    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  42.29 
 
 
844 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  42.77 
 
 
847 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  42.48 
 
 
863 aa  667    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 
822 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  42.66 
 
 
839 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  50.13 
 
 
814 aa  791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  48.81 
 
 
817 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  43.51 
 
 
839 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  47.99 
 
 
794 aa  763    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  47.74 
 
 
794 aa  763    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  50.38 
 
 
814 aa  792    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  43.13 
 
 
868 aa  657    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  42.29 
 
 
844 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  42.77 
 
 
793 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  48.8 
 
 
814 aa  754    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  48.62 
 
 
815 aa  769    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  43.16 
 
 
839 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  44.63 
 
 
849 aa  668    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  46.24 
 
 
803 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  41.38 
 
 
851 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
814 aa  1679    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  48.38 
 
 
804 aa  746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  43.26 
 
 
846 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  42.04 
 
 
825 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  42.41 
 
 
844 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.38 
 
 
817 aa  761    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  43.88 
 
 
861 aa  663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  49.06 
 
 
817 aa  788    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  48.65 
 
 
846 aa  813    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  48.71 
 
 
793 aa  757    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  44.14 
 
 
865 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  45.45 
 
 
839 aa  702    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  48.71 
 
 
793 aa  758    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2174  penicillin-binding protein 1A  41.94 
 
 
897 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.354055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00516  bifunctional murein transglycosylase/transpeptidase  40.58 
 
 
887 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  48.93 
 
 
803 aa  788    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  45.57 
 
 
807 aa  648    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  41.59 
 
 
843 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  50.25 
 
 
819 aa  801    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  43.39 
 
 
839 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  43.67 
 
 
839 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  48.14 
 
 
800 aa  727    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0369  penicillin-binding protein, 1A family protein  42.64 
 
 
885 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0358767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  48.45 
 
 
823 aa  777    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  42.21 
 
 
790 aa  635  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  42.13 
 
 
777 aa  631  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  40.45 
 
 
855 aa  631  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0723  1A family penicillin-binding protein  39.84 
 
 
866 aa  628  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  42.72 
 
 
851 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  43.05 
 
 
796 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  42.08 
 
 
791 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  39.41 
 
 
832 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 
835 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  44.19 
 
 
854 aa  615  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  44.06 
 
 
809 aa  615  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  42.48 
 
 
851 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  41.03 
 
 
850 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  40.91 
 
 
850 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  40.62 
 
 
852 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  42.52 
 
 
799 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  42.55 
 
 
799 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  43.65 
 
 
836 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  40.91 
 
 
850 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  40.91 
 
 
850 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  41.45 
 
 
852 aa  612  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  43.55 
 
 
790 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  40.79 
 
 
850 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  42.84 
 
 
840 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  41.31 
 
 
850 aa  608  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  44.32 
 
 
795 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  43.29 
 
 
833 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  44.24 
 
 
786 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  44.18 
 
 
797 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02356  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  43.55 
 
 
809 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  42.44 
 
 
852 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  43.97 
 
 
797 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  44.04 
 
 
796 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  42.91 
 
 
837 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  42.57 
 
 
839 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  40 
 
 
851 aa  602  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 
840 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 
846 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 
840 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 
840 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  42.12 
 
 
839 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  43.9 
 
 
797 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  43.76 
 
 
797 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  42.12 
 
 
839 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 
839 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  43.76 
 
 
797 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  42.12 
 
 
839 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  42.57 
 
 
840 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  42.57 
 
 
840 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  42.4 
 
 
838 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  41.91 
 
 
778 aa  598  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>