More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0754 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  66.71 
 
 		 796 aa  1041    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  65.31 
 
 		 818 aa  1056    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  46.96 
 
 		 797 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 818 aa  1659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  65.15 
 
 		 841 aa  1038    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  64.6 
 
 		 829 aa  1016    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  67.61 
 
 		 773 aa  1072    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  65.19 
 
 		 827 aa  1023    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  42.57 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  41.04 
 
 		 795 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  42.4 
 
 		 804 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  39.61 
 
 		 852 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  42.54 
 
 		 778 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  39.33 
 
 		 852 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  39.24 
 
 		 852 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  39.33 
 
 		 852 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  40.02 
 
 		 807 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  41.34 
 
 		 857 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  40.69 
 
 		 777 aa  545  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  39.74 
 
 		 807 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  41.57 
 
 		 862 aa  542  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  40.89 
 
 		 793 aa  539  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  39.59 
 
 		 846 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  39.59 
 
 		 831 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  39.52 
 
 		 807 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  40.55 
 
 		 779 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  40.42 
 
 		 794 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  39.85 
 
 		 831 aa  532  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  40.21 
 
 		 791 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  39.21 
 
 		 830 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  38.62 
 
 		 850 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.35 
 
 		 830 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  38.06 
 
 		 839 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  39.21 
 
 		 843 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  41.88 
 
 		 908 aa  528  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  38.57 
 
 		 850 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  39.73 
 
 		 835 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  38.74 
 
 		 850 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  39.1 
 
 		 819 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  38.62 
 
 		 851 aa  525  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  38.62 
 
 		 851 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  38.5 
 
 		 850 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  38.71 
 
 		 819 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  38.62 
 
 		 851 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  38.98 
 
 		 819 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  38.36 
 
 		 819 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  38.64 
 
 		 850 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  36.77 
 
 		 843 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  38.5 
 
 		 850 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 844 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  38.59 
 
 		 851 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  37.4 
 
 		 844 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  37.7 
 
 		 839 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  39.67 
 
 		 800 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  38.47 
 
 		 804 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  40.49 
 
 		 830 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  37.44 
 
 		 865 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  36.61 
 
 		 844 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 		 849 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  37.8 
 
 		 839 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  37.75 
 
 		 839 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 		 797 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  39.51 
 
 		 830 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  37.85 
 
 		 804 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.3 
 
 		 817 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 		 832 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  37.58 
 
 		 839 aa  515  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  38.35 
 
 		 833 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  37.58 
 
 		 850 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  37.45 
 
 		 850 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  37.58 
 
 		 850 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  37.58 
 
 		 850 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  39.9 
 
 		 771 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  37.58 
 
 		 850 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 		 847 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  37.58 
 
 		 850 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  38.33 
 
 		 797 aa  512  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  37.58 
 
 		 850 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 		 805 aa  512  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  37.33 
 
 		 823 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  38.45 
 
 		 851 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 824 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  37.33 
 
 		 823 aa  508  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  39 
 
 		 838 aa  509  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  37.45 
 
 		 858 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  36.58 
 
 		 822 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  37.33 
 
 		 823 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 803 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  37.64 
 
 		 799 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  37.06 
 
 		 814 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  37.85 
 
 		 814 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  37.91 
 
 		 815 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  37.16 
 
 		 852 aa  505  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  36.19 
 
 		 855 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  38.34 
 
 		 791 aa  506  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  37.85 
 
 		 805 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 		 804 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  38.68 
 
 		 817 aa  502  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  37.06 
 
 		 809 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  37.76 
 
 		 851 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>