More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3799 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  92.82 
 
 
850 aa  1657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  92.71 
 
 
850 aa  1655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  42.82 
 
 
830 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  55.11 
 
 
825 aa  918    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  42.02 
 
 
790 aa  648    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  45.41 
 
 
863 aa  759    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  78.14 
 
 
851 aa  1424    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  50.77 
 
 
839 aa  845    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  41.72 
 
 
814 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  79.46 
 
 
852 aa  1427    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  54.6 
 
 
855 aa  957    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  51.84 
 
 
846 aa  857    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  76 
 
 
852 aa  1353    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  92.82 
 
 
850 aa  1654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  99.65 
 
 
850 aa  1754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  44.14 
 
 
794 aa  686    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  44.14 
 
 
794 aa  684    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  99.65 
 
 
850 aa  1753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  49.08 
 
 
832 aa  856    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  50.12 
 
 
847 aa  814    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  100 
 
 
850 aa  1758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  92.94 
 
 
850 aa  1658    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  43.49 
 
 
814 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  51.41 
 
 
822 aa  827    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  50.83 
 
 
844 aa  842    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  50.88 
 
 
839 aa  840    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  74.56 
 
 
851 aa  1355    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  45.34 
 
 
793 aa  691    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  49.82 
 
 
851 aa  830    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  78.14 
 
 
851 aa  1424    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  78.38 
 
 
851 aa  1409    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  90.35 
 
 
850 aa  1622    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  92.82 
 
 
850 aa  1656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  49.47 
 
 
861 aa  815    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  52.02 
 
 
835 aa  907    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  92.82 
 
 
850 aa  1656    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00516  bifunctional murein transglycosylase/transpeptidase  45.83 
 
 
887 aa  797    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  42.25 
 
 
846 aa  648    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  50.06 
 
 
843 aa  849    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  99.65 
 
 
850 aa  1754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  92.59 
 
 
858 aa  1650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  50.89 
 
 
844 aa  840    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  49.82 
 
 
865 aa  833    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  52.02 
 
 
849 aa  863    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  78.14 
 
 
851 aa  1424    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  99.76 
 
 
850 aa  1756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  50.83 
 
 
839 aa  840    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0723  1A family penicillin-binding protein  46.63 
 
 
866 aa  757    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  45.1 
 
 
793 aa  687    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  42.05 
 
 
823 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  41.93 
 
 
819 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  78.26 
 
 
851 aa  1422    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  53.45 
 
 
846 aa  890    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  50.71 
 
 
839 aa  841    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  50.95 
 
 
839 aa  843    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0369  penicillin-binding protein, 1A family protein  47.74 
 
 
885 aa  796    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0358767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  92.82 
 
 
850 aa  1657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  50.71 
 
 
844 aa  841    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  42.13 
 
 
823 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  40.88 
 
 
817 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  41.12 
 
 
817 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.72 
 
 
817 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  41.24 
 
 
814 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  41.65 
 
 
815 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  41.64 
 
 
803 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  41.12 
 
 
817 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  43.81 
 
 
800 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  41.21 
 
 
817 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  41.54 
 
 
804 aa  623  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  40.91 
 
 
814 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  42.93 
 
 
803 aa  599  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  41.53 
 
 
846 aa  598  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  40.92 
 
 
777 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  38.64 
 
 
839 aa  571  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  40.15 
 
 
807 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  39.83 
 
 
793 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  39.34 
 
 
791 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  38.75 
 
 
868 aa  554  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  40.18 
 
 
854 aa  547  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  40.05 
 
 
809 aa  547  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2174  penicillin-binding protein 1A  37.21 
 
 
897 aa  547  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.354055 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  39.12 
 
 
778 aa  549  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  39.3 
 
 
799 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0395  1A family penicillin-binding protein  38.91 
 
 
940 aa  543  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.55 
 
 
799 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  39.05 
 
 
797 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  38.95 
 
 
795 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  38.39 
 
 
796 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 
797 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  38.46 
 
 
797 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.85 
 
 
797 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 
797 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  39.75 
 
 
790 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 
778 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  39.05 
 
 
839 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  39.17 
 
 
839 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  39.22 
 
 
837 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  39.17 
 
 
839 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  39.17 
 
 
839 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02356  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  39.95 
 
 
809 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>